More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0758 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  83.24 
 
 		 1241 aa  2141    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  47.39 
 
 		 1398 aa  1111    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  52.55 
 
 		 609 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 		 1243 aa  1037    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  41.83 
 
 		 1229 aa  931    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  49 
 
 		 1915 aa  1165    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 1241 aa  2546    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  48.85 
 
 		 1028 aa  931    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  45.59 
 
 		 1089 aa  890    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  49.8 
 
 		 1261 aa  1209    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  45.8 
 
 		 1332 aa  534  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  39.56 
 
 		 831 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 		 838 aa  362  3e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  30.11 
 
 		 1635 aa  349  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  28.85 
 
 		 743 aa  325  4e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  41.58 
 
 		 846 aa  310  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  41.33 
 
 		 846 aa  308  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.53 
 
 		 815 aa  307  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 		 850 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  44.96 
 
 		 431 aa  300  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 860 aa  291  7e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  37.61 
 
 		 859 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  37.35 
 
 		 1219 aa  281  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1232 aa  236  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 967 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  34.09 
 
 		 460 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  34.09 
 
 		 460 aa  175  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 395 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 		 455 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  37.87 
 
 		 386 aa  152  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 394 aa  152  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2369  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 770 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 		 374 aa  148  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 		 371 aa  145  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  36.44 
 
 		 381 aa  142  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  35.32 
 
 		 376 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 451 aa  140  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 382 aa  140  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 370 aa  139  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 370 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  32.58 
 
 		 351 aa  135  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 		 394 aa  134  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 370 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 420 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 382 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 384 aa  132  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.15 
 
 		 373 aa  131  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 400 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 381 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  31.88 
 
 		 380 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 378 aa  130  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  30.03 
 
 		 381 aa  128  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 		 381 aa  128  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 390 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 		 377 aa  127  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 373 aa  127  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 434 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 		 366 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.35 
 
 		 375 aa  125  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 435 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.35 
 
 		 375 aa  125  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  29.08 
 
 		 381 aa  125  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 		 417 aa  124  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 389 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 360 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 480 aa  123  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 384 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 380 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 382 aa  121  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 		 408 aa  121  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.21 
 
 		 366 aa  120  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 482 aa  121  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 380 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 		 387 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 385 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 444 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 395 aa  119  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  32.13 
 
 		 384 aa  119  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 375 aa  119  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 357 aa  118  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 378 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 763 aa  118  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 437 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 469 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 		 382 aa  116  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 376 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 		 390 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 397 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 346 aa  115  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 393 aa  115  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.69 
 
 		 346 aa  115  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 431 aa  115  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 384 aa  115  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 394 aa  115  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 374 aa  114  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 361 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 393 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 374 aa  112  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>