More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0757 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  74.21 
 
 		 442 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  100 
 
 		 442 aa  898    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  40.8 
 
 		 436 aa  298  9e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  61.32 
 
 		 272 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  48.05 
 
 		 646 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  61.32 
 
 		 272 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  48.59 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  43.19 
 
 		 1635 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  47.54 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  46.93 
 
 		 477 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  31.28 
 
 		 373 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  42.94 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  28.3 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  36.87 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1085 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  36.6 
 
 		 995 aa  83.6  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00750  hypothetical protein  33.57 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.32 
 
 		 345 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  39.6 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0201  methyltransferase type 12  32.77 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3279  hypothetical protein  27.07 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 256 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  37.61 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 256 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  28 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.38 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 200 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1457  hypothetical protein  31.09 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0152797  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  31.08 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  32.63 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 1177 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 1177 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  23.28 
 
 		 233 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  30.59 
 
 		 248 aa  57  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.08 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3895  methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 198 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  32.41 
 
 		 672 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3903  methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 198 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 237 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 		 234 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 1106 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.78 
 
 		 262 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.83 
 
 		 264 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 369 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 222 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 240 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1515  hypothetical protein  28.02 
 
 		 535 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 243 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 197 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  25.93 
 
 		 239 aa  55.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  31.88 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  28.96 
 
 		 262 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.14 
 
 		 235 aa  54.7  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.66 
 
 		 245 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  31.45 
 
 		 206 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 202 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 265 aa  54.7  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 235 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  27.38 
 
 		 226 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  33.04 
 
 		 229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  33.04 
 
 		 229 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  34.55 
 
 		 255 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 259 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 259 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  31.58 
 
 		 274 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  33.04 
 
 		 229 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 257 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 241 aa  53.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  31.63 
 
 		 265 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 267 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  26.36 
 
 		 199 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 303 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.65 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 240 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 		 237 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 238 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 226 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.67 
 
 		 233 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.96 
 
 		 258 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>