More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0620 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 270 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  99.63 
 
 		 270 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  94.44 
 
 		 270 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0698  pyrroline-5-carboxylate reductase  97.41 
 
 		 270 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.362648  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  94.07 
 
 		 270 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0246  pyrroline-5-carboxylate reductase  97.04 
 
 		 270 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0730  pyrroline-5-carboxylate reductase  97.04 
 
 		 270 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  88.06 
 
 		 270 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  88.06 
 
 		 270 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  87.04 
 
 		 270 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  88.06 
 
 		 270 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  87.69 
 
 		 270 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  87.69 
 
 		 270 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  87.69 
 
 		 270 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  87.69 
 
 		 270 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  80.37 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  78.52 
 
 		 271 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  78.52 
 
 		 271 aa  391  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.34 
 
 		 274 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.71 
 
 		 274 aa  311  7.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.97 
 
 		 289 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2938  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.11 
 
 		 273 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.21 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.58 
 
 		 278 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3701  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.51 
 
 		 274 aa  275  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.13 
 
 		 271 aa  271  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0581  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.96 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.948649  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.16 
 
 		 279 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.94 
 
 		 271 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5062  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.99 
 
 		 285 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.59 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 		 280 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0475  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.04 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2109  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.42 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.663148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2325  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.62 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.65 
 
 		 289 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3746  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.56 
 
 		 273 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.891447  normal  0.288204 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.28 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.26 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.12 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0381  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.94 
 
 		 288 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0372  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.94 
 
 		 288 aa  224  8e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.19 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.92 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.63 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.56 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.11 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.39 
 
 		 275 aa  218  8.999999999999998e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.82 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.18 
 
 		 272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.41 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.54 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.3 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.79 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.52 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.75 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.09 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  43.54 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.95 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.52 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.82 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.97 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.82 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03299  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4031  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01991  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.77 
 
 		 286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0542  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0647728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 277 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0774  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.86 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.222339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  41.52 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3608  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.26 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0139  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0829  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 273 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.814705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0831  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3041  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1535  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.66 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3451  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.51 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00381464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3354  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.5 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03579  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.39 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002455  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.91 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0012  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.92 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2683  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.87 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000101037  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1193  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.35 
 
 		 272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0154607  normal  0.507121 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3664  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.078533  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1192  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.97 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000775485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2478  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.3 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0810404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1263  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.59 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00228679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>