More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0605 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  97.85 
 
 		 186 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  91.94 
 
 		 186 aa  343  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  91.4 
 
 		 186 aa  342  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  91.4 
 
 		 186 aa  342  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  91.4 
 
 		 186 aa  342  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  87.63 
 
 		 186 aa  322  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  74.73 
 
 		 186 aa  284  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  74.73 
 
 		 186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  71.04 
 
 		 184 aa  270  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  78.16 
 
 		 206 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  69.95 
 
 		 184 aa  266  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  65.92 
 
 		 189 aa  261  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  81.61 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  81.61 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  81.61 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  81.61 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  81.61 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  81.61 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  81.61 
 
 		 187 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  80.35 
 
 		 187 aa  249  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  61.29 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  55.75 
 
 		 195 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  54.7 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  55.17 
 
 		 193 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  55.43 
 
 		 193 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  51.87 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  53.41 
 
 		 197 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  59.68 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  49.73 
 
 		 189 aa  175  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  50.29 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  46.67 
 
 		 197 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  49.73 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  48.24 
 
 		 182 aa  160  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  48.54 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  47.67 
 
 		 188 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  42.7 
 
 		 199 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  42.16 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  47.65 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  38.07 
 
 		 188 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  50.29 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  42.53 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  42.42 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  40.91 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  41.05 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.76 
 
 		 203 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  44.44 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  39.33 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  40.62 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  42.64 
 
 		 441 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  43.39 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  39.08 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  38.51 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  40.83 
 
 		 210 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  38.15 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  33.91 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  41.11 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  38.71 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  36.11 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  40.91 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  38.6 
 
 		 176 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  36.42 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  35.68 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  39.88 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.96 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  37.14 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  33.33 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  33.53 
 
 		 180 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  37.14 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  37.21 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  39.67 
 
 		 179 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  36.16 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  37.08 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.39 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.39 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  35.71 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.88 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  34.78 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  34.27 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  33.71 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  35.26 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  37.65 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.62 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  35.63 
 
 		 182 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  40.11 
 
 		 179 aa  98.2  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  40.45 
 
 		 197 aa  97.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  36.05 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  36.67 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  31.18 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  36.41 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  38.33 
 
 		 421 aa  96.3  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  33.15 
 
 		 182 aa  95.5  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  36.72 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  32.58 
 
 		 183 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3332  cytochrome B561  37.97 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.474748  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1084  cytochrome b561 family protein  34.09 
 
 		 177 aa  94.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.148515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  34.27 
 
 		 176 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>