158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0553 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  98.57 
 
 
140 aa  276  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  97.86 
 
 
140 aa  276  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  97.86 
 
 
140 aa  276  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  97.14 
 
 
140 aa  276  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  97.14 
 
 
140 aa  276  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  97.14 
 
 
140 aa  275  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  92.86 
 
 
140 aa  256  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  92.14 
 
 
147 aa  253  6e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  92.14 
 
 
147 aa  253  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  92.14 
 
 
140 aa  253  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  92.14 
 
 
140 aa  253  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  86.43 
 
 
140 aa  249  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  92.03 
 
 
138 aa  249  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  92.03 
 
 
138 aa  249  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  92.03 
 
 
138 aa  249  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  87.68 
 
 
138 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  87.68 
 
 
138 aa  247  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  64.29 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  69.29 
 
 
140 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  63.57 
 
 
140 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  63.57 
 
 
140 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  65.71 
 
 
140 aa  167  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  57.25 
 
 
141 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  63.38 
 
 
142 aa  152  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  62.68 
 
 
142 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  57.97 
 
 
141 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  57.75 
 
 
144 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  59.44 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  59.44 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  60.56 
 
 
142 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  58.74 
 
 
142 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  54.55 
 
 
146 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  58.45 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  58.45 
 
 
142 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  52.17 
 
 
136 aa  136  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  54.35 
 
 
140 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  50.71 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  52.9 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  45.39 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  54.35 
 
 
137 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  47.55 
 
 
142 aa  129  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  52.86 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  48.2 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  44.68 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  43.97 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0381  hypothetical protein  59.54 
 
 
131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.314635  normal  0.174306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  43.97 
 
 
141 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  46.15 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  43.97 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  50.7 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  47.14 
 
 
140 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  45.77 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  49.28 
 
 
140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  47.14 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  47.52 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  38.13 
 
 
148 aa  110  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  51.08 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  45.07 
 
 
142 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  42.03 
 
 
168 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  41.67 
 
 
142 aa  101  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  43.36 
 
 
140 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  37.68 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  37.59 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  38.41 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  38.3 
 
 
146 aa  95.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  39.58 
 
 
178 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  41.5 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  37.14 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  37.86 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  39.13 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  40.65 
 
 
172 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  38.57 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  40.97 
 
 
178 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  36.55 
 
 
178 aa  90.1  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  35.86 
 
 
178 aa  89.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  38.89 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0151  hypothetical protein  40.82 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  37.86 
 
 
143 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  35.86 
 
 
178 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  37.5 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  37.5 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  34.75 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1325  hypothetical protein  37.1 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0175884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01813  hypothetical protein  38.67 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0118637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0172  hypothetical protein  40.14 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  35.66 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  33.57 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  36.24 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  37.68 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  33.81 
 
 
187 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  33.81 
 
 
187 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  34.51 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  34 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  34.75 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  35 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  33.57 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  32.12 
 
 
197 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>