More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0552 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.76 
 
 		 423 aa  846    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 		 458 aa  770    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.11 
 
 		 423 aa  834    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  89.6 
 
 		 423 aa  766    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 		 423 aa  770    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.31 
 
 		 423 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  96.93 
 
 		 423 aa  829    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 		 423 aa  748    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 		 458 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  96.69 
 
 		 435 aa  802    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  93.14 
 
 		 423 aa  750    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  93.38 
 
 		 423 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.88 
 
 		 426 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 		 458 aa  770    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.11 
 
 		 423 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 		 458 aa  770    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.88 
 
 		 426 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  90.54 
 
 		 458 aa  770    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 423 aa  849    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.11 
 
 		 435 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.3 
 
 		 426 aa  628  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  74.88 
 
 		 426 aa  624  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.83 
 
 		 426 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.33 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.67 
 
 		 421 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.27 
 
 		 418 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.35 
 
 		 418 aa  558  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.1 
 
 		 421 aa  551  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.54 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.41 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.64 
 
 		 418 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0257  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.9 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.64 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.35 
 
 		 421 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.92 
 
 		 426 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  65.64 
 
 		 428 aa  531  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  68.35 
 
 		 421 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.03 
 
 		 421 aa  524  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.71 
 
 		 432 aa  527  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.8 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.47 
 
 		 430 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08350  gamma-glutamyl phosphate reductase  67.63 
 
 		 421 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.12 
 
 		 435 aa  518  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.23 
 
 		 436 aa  518  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.31 
 
 		 421 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.41 
 
 		 429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.9 
 
 		 425 aa  514  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.53 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.19 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.86 
 
 		 444 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.56 
 
 		 430 aa  510  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0293  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.94 
 
 		 433 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00187024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.95 
 
 		 437 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.9 
 
 		 426 aa  504  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4974  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.79 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.126752  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.07 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.14 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0322  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.47 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3262  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.66 
 
 		 426 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.960329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  0.000000132471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.11 
 
 		 423 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  63.31 
 
 		 423 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6000  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.14 
 
 		 426 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137203 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.19 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.87 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4007  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.56 
 
 		 439 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000305093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.52 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 		 418 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  53.83 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 		 418 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.54 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.47 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.3 
 
 		 418 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.36 
 
 		 418 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 456 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.99 
 
 		 418 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.82 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.87 
 
 		 418 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1238  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  55.11 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.84 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.24 
 
 		 417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.56 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.66 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.63 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.33 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3876  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0207983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.12 
 
 		 419 aa  403  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.63 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4200  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.49 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0444  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.25 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.312195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4280  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>