More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0546 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 265 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  98.87 
 
 		 265 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  95.85 
 
 		 265 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  95.09 
 
 		 265 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  95.09 
 
 		 265 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  95.09 
 
 		 265 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  93.21 
 
 		 265 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  81.51 
 
 		 265 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  81.13 
 
 		 268 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  81.13 
 
 		 268 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  81.13 
 
 		 265 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  81.51 
 
 		 268 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  80.75 
 
 		 268 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  80.75 
 
 		 268 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  80.75 
 
 		 268 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  80.75 
 
 		 268 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  79.62 
 
 		 265 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  81.1 
 
 		 254 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  71.21 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  68.68 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  70.94 
 
 		 265 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  69.43 
 
 		 266 aa  367  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  71.86 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  68.18 
 
 		 269 aa  361  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  71.43 
 
 		 284 aa  361  8e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  68.44 
 
 		 282 aa  359  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  72.45 
 
 		 265 aa  357  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  70.08 
 
 		 254 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4608  dihydrodipicolinate reductase  70.08 
 
 		 270 aa  342  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  64.77 
 
 		 267 aa  341  9e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  65.53 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3789  dihydrodipicolinate reductase  68.18 
 
 		 271 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  64.77 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  61.51 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  64.02 
 
 		 268 aa  332  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  65.91 
 
 		 263 aa  328  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  64.39 
 
 		 278 aa  321  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  63.26 
 
 		 263 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  63.26 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 		 273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1729  dihydrodipicolinate reductase  64.15 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  58.65 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 		 267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  59.62 
 
 		 273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  60.38 
 
 		 273 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  59.62 
 
 		 273 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  60 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  57.14 
 
 		 269 aa  300  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  60 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  60 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  60 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  59.25 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 267 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  58.87 
 
 		 273 aa  298  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 267 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  60.15 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  59.4 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  59.4 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  59.4 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  59.77 
 
 		 273 aa  295  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  58.87 
 
 		 267 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  57.74 
 
 		 268 aa  294  8e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  61.89 
 
 		 273 aa  294  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  59.4 
 
 		 267 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  55.85 
 
 		 270 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  58.87 
 
 		 267 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 270 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  59.25 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  60.53 
 
 		 273 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 273 aa  288  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  56.39 
 
 		 270 aa  286  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  60.53 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  55.09 
 
 		 270 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  55.09 
 
 		 270 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 270 aa  284  9e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  55.09 
 
 		 270 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  55.09 
 
 		 270 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 270 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 270 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  58.27 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  58.27 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 270 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 274 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 		 270 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  54.14 
 
 		 271 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  57.36 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  54.89 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  53.76 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  52.83 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  55.64 
 
 		 267 aa  275  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  51.13 
 
 		 275 aa  275  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  54.51 
 
 		 271 aa  275  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  56.77 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>