More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0521 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0521  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 260 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.847891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0545  short chain dehydrogenase  99.23 
 
 		 259 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.074184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  92.69 
 
 		 260 aa  481  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0137  short chain dehydrogenase  91.54 
 
 		 260 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0620  short chain dehydrogenase  91.54 
 
 		 260 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0588  short chain dehydrogenase  91.92 
 
 		 260 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194347  normal  0.0391008 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2765  short chain dehydrogenase  91.54 
 
 		 260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  80.69 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  80.69 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  80.69 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  80.69 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  80.31 
 
 		 259 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  80.31 
 
 		 269 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  79.92 
 
 		 269 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  80.31 
 
 		 258 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1178  short chain dehydrogenase  78.76 
 
 		 269 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  80.31 
 
 		 258 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  79.92 
 
 		 258 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4142  short chain dehydrogenase  60.47 
 
 		 272 aa  317  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  54.05 
 
 		 259 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  52.51 
 
 		 259 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  52.51 
 
 		 259 aa  281  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  54.47 
 
 		 261 aa  271  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  56.37 
 
 		 269 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  54.02 
 
 		 258 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  54.44 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.14 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.27 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 		 246 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  44.31 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.46 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.06 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.97 
 
 		 246 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.86 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.48 
 
 		 252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.08 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.22 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  39.53 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.35 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.6 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 250 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.3 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  42.97 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>