More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0503 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0527  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0503  redoxin domain-containing protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2783  redoxin domain-containing protein  95.81 
 
 		 167 aa  320  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0601  redoxin domain-containing protein  95.81 
 
 		 167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0570  redoxin domain-containing protein  95.81 
 
 		 167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.913258  hitchhiker  0.00016403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0118  redoxin  95.21 
 
 		 167 aa  317  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3684  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  95.21 
 
 		 167 aa  315  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.484477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  89.22 
 
 		 167 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  86.23 
 
 		 167 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1285  thiol peroxidase  86.23 
 
 		 167 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.850808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  86.23 
 
 		 167 aa  292  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  86.23 
 
 		 167 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  86.23 
 
 		 167 aa  292  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  86.23 
 
 		 167 aa  292  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3469  thiol peroxidase  85.63 
 
 		 167 aa  291  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  82.04 
 
 		 166 aa  275  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  80.84 
 
 		 166 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  80.24 
 
 		 166 aa  271  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  74.85 
 
 		 166 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  74.85 
 
 		 166 aa  248  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  74.25 
 
 		 166 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  70.06 
 
 		 166 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  71.26 
 
 		 166 aa  233  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  69.51 
 
 		 163 aa  226  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  69.46 
 
 		 166 aa  224  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  65.85 
 
 		 165 aa  224  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  68.71 
 
 		 166 aa  220  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  65.66 
 
 		 165 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  66.67 
 
 		 167 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  65.06 
 
 		 165 aa  215  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  64.02 
 
 		 167 aa  215  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2616  thiol peroxidase  64.63 
 
 		 167 aa  215  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  64.02 
 
 		 167 aa  215  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2328  redoxin domain-containing protein  64.07 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  65.87 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2803  redoxin domain-containing protein  64.07 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.919062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2481  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  64.67 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.475096 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2185  redoxin domain-containing protein  63.47 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  65.27 
 
 		 167 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  65.27 
 
 		 167 aa  211  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1768  thiol peroxidase  62.05 
 
 		 167 aa  210  7e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3587  redoxin domain protein  62.87 
 
 		 166 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  62.05 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  62.28 
 
 		 166 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2520  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  59.88 
 
 		 166 aa  205  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2603  thiol peroxidase  61.31 
 
 		 167 aa  205  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2321  thiol peroxidase  60.71 
 
 		 167 aa  203  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  60.24 
 
 		 166 aa  202  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1535  thiol peroxidase  59.52 
 
 		 168 aa  200  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01301  thiol peroxidase  59.52 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2322  Redoxin domain protein  59.52 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00106183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2301  thiol peroxidase  59.52 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1798  thiol peroxidase  59.52 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01312  hypothetical protein  59.52 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00805067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1439  thiol peroxidase  59.52 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1969  thiol peroxidase  59.52 
 
 		 168 aa  200  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal  0.35715 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1733  thiol peroxidase  60.12 
 
 		 167 aa  199  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.777022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1557  thiol peroxidase  58.93 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1468  thiol peroxidase  58.33 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.31622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1868  thiol peroxidase  58.33 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.188696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1807  thiol peroxidase  58.33 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.435171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1650  thiol peroxidase  58.33 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103223  hitchhiker  0.00495137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1806  thiol peroxidase  58.33 
 
 		 168 aa  197  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000411429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2432  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  62.87 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.399489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  56.02 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  57.49 
 
 		 166 aa  191  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2151  thiol peroxidase  55.95 
 
 		 168 aa  191  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3734  redoxin  57.23 
 
 		 164 aa  190  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.085288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2114  redoxin domain-containing protein  56.63 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  53.61 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  55.42 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  57.14 
 
 		 179 aa  184  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  58.43 
 
 		 165 aa  185  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  54.22 
 
 		 173 aa  181  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22170  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  56.63 
 
 		 165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  54.49 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  54.22 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  54.22 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  57.23 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1552  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  56.02 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1604  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  54.22 
 
 		 169 aa  177  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.510927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  51.2 
 
 		 166 aa  175  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  53.61 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2756  redoxin domain protein  53.01 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  53.37 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  53.89 
 
 		 165 aa  170  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  49.7 
 
 		 199 aa  168  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  48.8 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  51.2 
 
 		 165 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11961  thiol peroxidase  53.01 
 
 		 165 aa  161  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196708  normal  0.378209 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  50 
 
 		 172 aa  160  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  48.17 
 
 		 197 aa  160  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  48.5 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  46.71 
 
 		 179 aa  157  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0346  Redoxin domain protein  48.5 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3254  thiol peroxidase  52.69 
 
 		 165 aa  157  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15610  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  52.47 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0239273  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  46.11 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0349  thiol peroxidase  46.01 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3537  thiol peroxidase  44.31 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.515371 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>