More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0502 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  99.36 
 
 		 312 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  96.47 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  83.65 
 
 		 312 aa  547  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  82.05 
 
 		 312 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  82.05 
 
 		 312 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  82.05 
 
 		 312 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  80.13 
 
 		 312 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  80.45 
 
 		 312 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  80.45 
 
 		 312 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  80.13 
 
 		 312 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  80.45 
 
 		 312 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  80.13 
 
 		 312 aa  534  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  79.49 
 
 		 312 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  78.14 
 
 		 314 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  74.92 
 
 		 312 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  74.28 
 
 		 312 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  78.8 
 
 		 283 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  63.46 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  64.1 
 
 		 311 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  61.98 
 
 		 315 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  63.78 
 
 		 311 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  61.98 
 
 		 315 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  59.38 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  62.34 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  58.44 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  56.96 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  55.95 
 
 		 310 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  59.73 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  55.77 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  54.86 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  59.86 
 
 		 298 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  59.52 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  54.98 
 
 		 310 aa  362  6e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  55.84 
 
 		 311 aa  360  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  58.44 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  57.37 
 
 		 311 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  57 
 
 		 300 aa  358  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  54.37 
 
 		 310 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  56.48 
 
 		 307 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  57.82 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  53.8 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  53.8 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  55.44 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  54.02 
 
 		 316 aa  346  4e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  55.44 
 
 		 298 aa  344  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  55.67 
 
 		 320 aa  340  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  53 
 
 		 301 aa  325  5e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  52.82 
 
 		 302 aa  321  9.000000000000001e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  40.65 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  41.53 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  41.1 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  40.65 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  40.38 
 
 		 312 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  39.81 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 		 318 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  36.83 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  36.01 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  37.7 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  36.57 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  35.14 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  36.13 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  36.25 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  34.81 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  34.84 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  34.82 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  32.91 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  35.84 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  35.46 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  35.46 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  35.46 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  34.75 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  34.95 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  34.49 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  35.67 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  33.01 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  32.49 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  33.33 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  30.94 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  30.32 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  28.04 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  30.3 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  30.83 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  26.4 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  29.53 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  26 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.16 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  28.46 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  24.19 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>