More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0413 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  100 
 
 		 280 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  98.93 
 
 		 280 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  93.57 
 
 		 280 aa  510  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  92.86 
 
 		 280 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  92.86 
 
 		 280 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  92.86 
 
 		 280 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  91.04 
 
 		 280 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  80.43 
 
 		 285 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3615  protein hemK  77.54 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0503  hemK protein  77.54 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3604  protein methyltransferase HemK  77.17 
 
 		 285 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1944  protein hemK  77.54 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0973  methyltransferase, HemK family protein  77.54 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.199925  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0677  methyltransferase, HemK family protein  77.54 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3591  putative protein hemK  77.54 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.334574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  71.32 
 
 		 286 aa  363  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  67.87 
 
 		 283 aa  358  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  69.85 
 
 		 286 aa  358  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3046  modification methylase HemK  57.51 
 
 		 289 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  57.3 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3203  HemK family modification methylase  56.77 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2800  modification methylase, HemK family  56.72 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.668211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3148  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  55.97 
 
 		 300 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709497  normal  0.0196478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  54.89 
 
 		 289 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  51.33 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  47.69 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  48.23 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.87 
 
 		 275 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.09 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.131703  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  50.7 
 
 		 280 aa  222  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  51.13 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  50.36 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  51.15 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  50.19 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  51.67 
 
 		 280 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0135  HemK family modification methylase  44.37 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000756986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.71 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  42.59 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  42.59 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.72 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.72 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.72 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.72 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3598  HemK family modification methylase  42.38 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0339  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.89 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.22 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  45.93 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2435  modification methylase, HemK family  45.15 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000273113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1317  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.15 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1376  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.15 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000091189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1930  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.15 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00345869  normal  0.0875835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02572  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase(HemK)  42.49 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.237156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2414  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.15 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0911991  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  44.23 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  43.98 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.54 
 
 		 281 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1360  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.15 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000216637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  50.56 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1693  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.15 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0062068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  49.45 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01187  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.78 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  42.96 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01197  hypothetical protein  44.78 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.337876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  41.04 
 
 		 285 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  48.89 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  42.69 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  45.9 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  42.21 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.42 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  49.46 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.41 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  50.86 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  47.58 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  46.33 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  44.32 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  42.75 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  48.73 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.62 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2565  hemK family protein  44.36 
 
 		 285 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.264482  normal  0.189465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  49.62 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  47.25 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  48.4 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.56 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  48.24 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  48.01 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  41.89 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.83 
 
 		 276 aa  192  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  42.15 
 
 		 279 aa  191  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  48.87 
 
 		 283 aa  191  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  43.18 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  48.31 
 
 		 275 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0921  HemK family modification methylase  42.97 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00723704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.22 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  41.06 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3458  HemK family modification methylase  40.43 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.430635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  41.15 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  49.62 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  45.39 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  41.15 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  41.15 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>