52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0399 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  320  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  96.95 
 
 		 164 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  90.24 
 
 		 183 aa  276  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  89.02 
 
 		 164 aa  273  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  89.02 
 
 		 164 aa  273  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  89.63 
 
 		 164 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  86.5 
 
 		 180 aa  255  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  68.09 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  68.09 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  62.42 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  67.16 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  57.72 
 
 		 196 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  54.14 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  55.06 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  56.62 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  53.38 
 
 		 176 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  51.72 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  55.38 
 
 		 157 aa  150  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  50.94 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  57.55 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  52.31 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  58.65 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  53.08 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  47.4 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  52.27 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  49.21 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  38.64 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  35.65 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  38.2 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  31.54 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  33.09 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  30.88 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  28 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  27.08 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  28.45 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  26.81 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  31.71 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3319  Late embryogenesis abundant protein 2  31.73 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000162689  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.76 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  26.76 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0927  Late embryogenesis abundant protein 2  30.77 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5672e-31 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  24.81 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  26.79 
 
 		 136 aa  44.3  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>