164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0382 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02046  EvpB  78.44 
 
 
498 aa  835  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  69.17 
 
 
500 aa  691  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  99.4 
 
 
496 aa  1019  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  99.6 
 
 
496 aa  1021  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  67.89 
 
 
499 aa  710  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  93.15 
 
 
496 aa  957  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  67.2 
 
 
500 aa  686  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  100 
 
 
496 aa  1025  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  5.70497e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1025  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  99.6 
 
 
496 aa  1021  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  2.82714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4914  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  93.31 
 
 
496 aa  931  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  3.26238e-06  normal  0.0140639 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  92.94 
 
 
496 aa  955  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  92.94 
 
 
496 aa  955  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  67.2 
 
 
500 aa  687  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  68.41 
 
 
500 aa  686  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  92.94 
 
 
496 aa  955  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  98.19 
 
 
496 aa  1010  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  77.62 
 
 
494 aa  809  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.22545e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  67.2 
 
 
500 aa  686  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  88.08 
 
 
496 aa  887  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  99.6 
 
 
496 aa  1021  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  60.12 
 
 
495 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  59.11 
 
 
495 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  56.12 
 
 
494 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  56.12 
 
 
494 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3407  hypothetical protein  56.12 
 
 
494 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1732  hypothetical protein  55.93 
 
 
500 aa  552  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.473606  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5979  EvpB family type VI secretion protein  53.07 
 
 
502 aa  541  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50810  DUF877 family protein  54.79 
 
 
493 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6050  hypothetical protein  51.82 
 
 
493 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3072  hypothetical protein  51.79 
 
 
497 aa  531  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1530  hypothetical protein  50.61 
 
 
491 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.704852  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3026  hypothetical protein  52.19 
 
 
494 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00788252  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000021  uncharacterized protein ImpC  49.9 
 
 
497 aa  507  1e-142  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.147425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2368  hypothetical protein  49 
 
 
497 aa  506  1e-142  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  48.59 
 
 
501 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  48.18 
 
 
499 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  48.18 
 
 
499 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  48.63 
 
 
499 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  49.47 
 
 
499 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  48.18 
 
 
499 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  47.27 
 
 
497 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00265  SciI protein  48.59 
 
 
500 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  47.68 
 
 
499 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  48.79 
 
 
500 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  48.79 
 
 
500 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  48.79 
 
 
500 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  49.89 
 
 
497 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  48.43 
 
 
497 aa  469  1e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0194  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  46.57 
 
 
502 aa  469  1e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  45.95 
 
 
497 aa  469  1e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6674  EvpB family type VI secretion protein  49.79 
 
 
499 aa  471  1e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585519  normal  0.849864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3027  EvpB family type VI secretion protein  50 
 
 
499 aa  470  1e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1587  hypothetical protein  50 
 
 
502 aa  468  1e-130  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  48.29 
 
 
502 aa  467  1e-130  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  45.73 
 
 
497 aa  466  1e-130  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2959  hypothetical protein  50.21 
 
 
502 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2834  hypothetical protein  50.21 
 
 
502 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0454  hypothetical protein  50.21 
 
 
502 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  47.15 
 
 
498 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  47.22 
 
 
498 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.005e-08 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  50.21 
 
 
502 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0306  type VI secretion protein, EvpB/family  47.07 
 
 
502 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44726  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1199  hypothetical protein  50.21 
 
 
502 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0404  hypothetical protein  50.21 
 
 
502 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1601  hypothetical protein  50.21 
 
 
502 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  46.41 
 
 
500 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0300  EvpB family type VI secretion protein  47.07 
 
 
502 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205878  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0297  SciI protein  47.27 
 
 
502 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.770201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0312  type VI secretion protein, EvpB/family  47.07 
 
 
502 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01020  hypothetical protein  47.56 
 
 
498 aa  461  1e-128  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  46.67 
 
 
497 aa  461  1e-128  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0156  hypothetical protein  47.36 
 
 
498 aa  459  1e-128  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0242  hypothetical protein  45.63 
 
 
499 aa  459  1e-128  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2184  hypothetical protein  45.44 
 
 
499 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968524  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3475  hypothetical protein  47.67 
 
 
497 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217295  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1694  hypothetical protein  45.44 
 
 
530 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1209  hypothetical protein  45.44 
 
 
499 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1910  hypothetical protein  45.44 
 
 
499 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0922  hypothetical protein  45.44 
 
 
499 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0333  hypothetical protein  45.44 
 
 
499 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3435  hypothetical protein  45.99 
 
 
500 aa  455  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0762  hypothetical protein  45.99 
 
 
500 aa  455  1e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.277703  normal  0.125026 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3564  EvpB family type VI secretion protein  45.99 
 
 
503 aa  455  1e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3040  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  46.74 
 
 
506 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0940  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  47.97 
 
 
499 aa  446  1e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205966  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0549  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  45.51 
 
 
497 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0790  hypothetical protein  46.67 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0748  hypothetical protein  46.67 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1900  hypothetical protein  46.67 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0439  hypothetical protein  46.67 
 
 
503 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.395264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0701  hypothetical protein  46.67 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2017  hypothetical protein  46.67 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1043  hypothetical protein  46.67 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2075  hypothetical protein  46.67 
 
 
501 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2361  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  46.88 
 
 
504 aa  435  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0877171 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2444  hypothetical protein  44.23 
 
 
504 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  0.792489 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3478  hypothetical protein  45.19 
 
 
505 aa  405  1e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.384738  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1172  putative type VI secretion protein VasRA-1  43.91 
 
 
493 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.217687  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3122  hypothetical protein  44.98 
 
 
503 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.048551  normal  0.0269091 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>