155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0381 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0402  type VI secretion protein  100 
 
 
171 aa  335  1e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  1.94603e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0381  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  335  1e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00433333  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3559  hypothetical protein  99.42 
 
 
171 aa  334  3e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00132458  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0467  hypothetical protein  99.42 
 
 
171 aa  334  3e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00157357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0445  type VI secretion protein  99.42 
 
 
171 aa  334  3e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.493585  normal  0.482575 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2639  hypothetical protein  99.42 
 
 
171 aa  334  3e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00139416  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2930  type VI secretion protein  97.08 
 
 
171 aa  328  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00592536  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2964  EvpA  88.37 
 
 
172 aa  299  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3660  hypothetical protein  88.37 
 
 
172 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471211  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3635  hypothetical protein  88.37 
 
 
172 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0300878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3645  EvpA  88.37 
 
 
172 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0328511  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4913  type VI secretion protein, VC_A0107 family  85.47 
 
 
182 aa  293  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  4.68167e-08  normal  0.0151327 
 
 
-
 
NC_003296  RS01965  hypothetical protein  79.41 
 
 
170 aa  271  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.380992  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2177  hypothetical protein  68.45 
 
 
170 aa  230  7e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.4001e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02045  EvpA  67.9 
 
 
166 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.792135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2268  hypothetical protein  60 
 
 
177 aa  203  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923124  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3100  hypothetical protein  59.39 
 
 
191 aa  199  2e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.310088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2622  hypothetical protein  59.39 
 
 
179 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2764  type VI secretion protein  59.39 
 
 
179 aa  197  4e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0599499  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2510  type VI secretion protein  58.79 
 
 
177 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203105  normal  0.816356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4953  hypothetical protein  58.18 
 
 
177 aa  194  4e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50800  hypothetical protein  55.77 
 
 
187 aa  177  7e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3043  type VI secretion protein, VC_A0107 family  53.16 
 
 
176 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1207  type VI secretion protein, VC_A0107 family  53.16 
 
 
176 aa  175  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3406  hypothetical protein  53.85 
 
 
180 aa  168  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34070  hypothetical protein  51.92 
 
 
181 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0502886  normal  0.0617525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2896  hypothetical protein  51.92 
 
 
181 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1529  hypothetical protein  50.3 
 
 
167 aa  165  3e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000020  uncharacterized protein ImpB  48.72 
 
 
176 aa  157  7e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5978  type VI secretion protein  48.39 
 
 
190 aa  147  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.785874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2369  hypothetical protein  44.87 
 
 
166 aa  145  4e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3073  hypothetical protein  46.67 
 
 
168 aa  144  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.747125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1171  putative type VI secretion protein VasQ-1  42.5 
 
 
169 aa  139  1e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1733  hypothetical protein  45.16 
 
 
182 aa  140  1e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541869  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2461  type VI secretion protein, VC_A0107 family  47.2 
 
 
176 aa  139  2e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3028  type VI secretion protein  46.63 
 
 
178 aa  138  4e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6673  type VI secretion protein  46.63 
 
 
185 aa  137  8e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72757  normal  0.388479 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6051  hypothetical protein  46.15 
 
 
171 aa  137  9e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0980  hypothetical protein  45.91 
 
 
179 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3474  hypothetical protein  43.9 
 
 
180 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279026  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1605  hypothetical protein  46.01 
 
 
179 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.350128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0157  hypothetical protein  46.01 
 
 
179 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0133  hypothetical protein  46.01 
 
 
179 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0334  hypothetical protein  43.56 
 
 
193 aa  135  3e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0243  hypothetical protein  43.56 
 
 
193 aa  135  3e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0871713  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3907  type VI secretion protein  43.56 
 
 
179 aa  134  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1683  type VI secretion protein, VC_A0107 family  44.17 
 
 
179 aa  133  1e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0225402 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0941  type VI secretion protein, VC_A0107 family  44.38 
 
 
181 aa  132  2e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2183  hypothetical protein  42.94 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.945386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6114  type VI secretion protein  44.3 
 
 
177 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.27143 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0921  hypothetical protein  42.94 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1208  hypothetical protein  42.94 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1909  hypothetical protein  42.94 
 
 
193 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26670  hypothetical protein (UCP028301)  45.28 
 
 
188 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.10267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3003  hypothetical protein  44.38 
 
 
178 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0121  hypothetical protein  45.86 
 
 
179 aa  130  7e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1479  type VI secretion protein  43.56 
 
 
174 aa  130  7e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.276644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2871  hypothetical protein  43.56 
 
 
174 aa  130  7e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1367  hypothetical protein  43.56 
 
 
174 aa  130  7e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.466171  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3025  hypothetical protein  45.51 
 
 
167 aa  130  1e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0474697  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0193  type VI secretion protein, VC_A0107 family  43.75 
 
 
189 aa  130  1e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1695  hypothetical protein  44.81 
 
 
1238 aa  129  2e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0155  hypothetical protein  42.94 
 
 
172 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0296  hypothetical protein  42.33 
 
 
180 aa  127  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.822214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0299  type VI secretion protein  42.33 
 
 
180 aa  128  5e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.506089  normal  0.154697 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2960  hypothetical protein  44.59 
 
 
192 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0305  type VI secretion protein, family  42.33 
 
 
180 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1200  hypothetical protein  44.59 
 
 
192 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4091  type VI secretion protein  44.03 
 
 
168 aa  127  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.40512e-07 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0311  type VI secretion protein, family  42.33 
 
 
180 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2835  hypothetical protein  44.59 
 
 
192 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.561287  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0258  hypothetical protein  43.31 
 
 
193 aa  126  1e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2322  hypothetical protein  43.04 
 
 
171 aa  125  2e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239725  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3850  type VI secretion protein  43.95 
 
 
180 aa  125  2e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.453706  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01010  hypothetical protein  42.33 
 
 
172 aa  126  2e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0453  hypothetical protein  43.95 
 
 
192 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1783  hypothetical protein  43.95 
 
 
192 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0403  hypothetical protein  43.95 
 
 
192 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3041  type VI secretion protein, VC_A0107 family  43.4 
 
 
178 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1600  hypothetical protein  43.95 
 
 
192 aa  124  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0550  type VI secretion protein, VC_A0107 family  44.31 
 
 
172 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2095  putative cytoplasmic protein  43.48 
 
 
182 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1476  hypothetical protein  42.68 
 
 
182 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1588  hypothetical protein  41.92 
 
 
184 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.149001  normal  0.271406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2360  type VI secretion protein, VC_A0107 family  42.35 
 
 
183 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0763  hypothetical protein  39.16 
 
 
186 aa  119  1e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.184659  normal  0.121475 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3565  type VI secretion protein  39.16 
 
 
186 aa  119  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3436  hypothetical protein  39.16 
 
 
186 aa  119  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00868528  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2018  type VI secretion protein  36.63 
 
 
182 aa  109  2e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0789  hypothetical protein  36.63 
 
 
182 aa  109  2e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2074  hypothetical protein  36.63 
 
 
182 aa  109  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.385689  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0700  hypothetical protein  36.63 
 
 
182 aa  109  2e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1901  hypothetical protein  36.48 
 
 
183 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00266  hypothetical protein  40.14 
 
 
150 aa  104  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3121  hypothetical protein  38.65 
 
 
176 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.241786  normal  0.0428701 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3477  hypothetical protein  38.65 
 
 
176 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.772504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2443  hypothetical protein  35.93 
 
 
180 aa  97.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.485859  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2814  hypothetical protein  34.62 
 
 
175 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000441  uncharacterized protein ImpB  36.5 
 
 
168 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05863  hypothetical protein  35.1 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>