99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0379 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  405  1e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  84 
 
 
200 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  83 
 
 
292 aa  337  6e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  83.5 
 
 
204 aa  337  6e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  83.5 
 
 
204 aa  337  6e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  97.52 
 
 
202 aa  335  3e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  91.63 
 
 
203 aa  325  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  94.5 
 
 
203 aa  318  2e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  94.5 
 
 
203 aa  318  2e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  94.5 
 
 
203 aa  318  2e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  78.54 
 
 
210 aa  315  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.03231e-07  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  92.12 
 
 
203 aa  313  1e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  62.77 
 
 
193 aa  236  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2179  putative lipoprotein  38.82 
 
 
189 aa  131  8e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.18689e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  41.92 
 
 
202 aa  130  2e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  34.72 
 
 
240 aa  68.6  6e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  34.72 
 
 
240 aa  68.6  6e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  26.92 
 
 
181 aa  67.8  1e-10  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  37.7 
 
 
240 aa  67.4  1e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  37.37 
 
 
172 aa  64.3  1e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  37.37 
 
 
172 aa  64.3  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  37.37 
 
 
172 aa  64.3  1e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  37.37 
 
 
172 aa  64.3  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  37.37 
 
 
172 aa  64.3  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  37.37 
 
 
191 aa  64.3  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  27.27 
 
 
151 aa  64.3  1e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  37.37 
 
 
179 aa  64.3  1e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  35.25 
 
 
240 aa  62.8  3e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  35.35 
 
 
171 aa  62.4  5e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  33.59 
 
 
154 aa  62  6e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  32.56 
 
 
251 aa  62  6e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  36.36 
 
 
172 aa  61.6  8e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  30.23 
 
 
154 aa  59.7  3e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  30.71 
 
 
167 aa  59.3  4e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.33 
 
 
171 aa  58.9  5e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  31.36 
 
 
162 aa  57.4  1e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  33.33 
 
 
166 aa  57.8  1e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  30.16 
 
 
189 aa  57  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  24.66 
 
 
177 aa  56.2  3e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  31.96 
 
 
192 aa  54.3  1e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  30.5 
 
 
167 aa  54.3  1e-06  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  30.5 
 
 
167 aa  54.3  1e-06  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  30.5 
 
 
167 aa  54.3  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  26.39 
 
 
170 aa  54.3  1e-06  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  31 
 
 
168 aa  53.9  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  30.5 
 
 
167 aa  54.3  1e-06  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  27.74 
 
 
167 aa  53.9  2e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  31 
 
 
168 aa  53.9  2e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  29.41 
 
 
166 aa  52.8  3e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  27.46 
 
 
163 aa  52.8  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  27.46 
 
 
163 aa  52.8  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  27.46 
 
 
163 aa  52.8  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  27.46 
 
 
163 aa  52.8  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  30.69 
 
 
207 aa  52.4  5e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  30.3 
 
 
187 aa  52  6e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  26.56 
 
 
212 aa  52  6e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  22.52 
 
 
176 aa  52  7e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  27.88 
 
 
168 aa  51.6  9e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  27.43 
 
 
190 aa  50.8  1e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  27.84 
 
 
199 aa  50.4  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  31 
 
 
160 aa  50.4  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  30.93 
 
 
155 aa  49.7  3e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.38 
 
 
177 aa  49.7  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.14 
 
 
174 aa  49.3  4e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  26.36 
 
 
168 aa  49.3  4e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  23.38 
 
 
177 aa  48.9  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  26.13 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  22.76 
 
 
173 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  34.09 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  23.45 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  25.64 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  27.68 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  27.94 
 
 
172 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  25.23 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.68 
 
 
178 aa  45.1  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  26.73 
 
 
154 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58047e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  21.19 
 
 
180 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  31.21 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  31.21 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  31.21 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  27.37 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.78046e-06 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  25 
 
 
163 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.48 
 
 
174 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  22.02 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25.69 
 
 
172 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  29.37 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  21.85 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  25.24 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  20.95 
 
 
210 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0234  type VI secretion lipoprotein  22.76 
 
 
174 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  32.1 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  32.1 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  4.78166e-07 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  32.1 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  26.77 
 
 
157 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  24.38 
 
 
178 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  23.94 
 
 
166 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  23.02 
 
 
156 aa  42  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  29.49 
 
 
179 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  30.86 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>