More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0277 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  243  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  6.32835e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  100 
 
 
122 aa  243  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  2.438e-07  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  240  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  9.89644e-10  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  98.36 
 
 
162 aa  240  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  240  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  7.75128e-05  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  240  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  8.52888e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  240  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  1.57249e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  239  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  3.3095e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  239  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  239  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  239  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  239  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  239  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.83624e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  239  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  98.36 
 
 
122 aa  239  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  9.01692e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3634  50S ribosomal protein L14  97.54 
 
 
122 aa  237  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  2.65489e-05  decreased coverage  1.45163e-12 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0324  50S ribosomal protein L14  97.54 
 
 
122 aa  237  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  7.08463e-06  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2829  50S ribosomal protein L14  96.72 
 
 
122 aa  236  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000599827  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3169  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  229  7e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  2.5532e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3307  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  229  7e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.45042e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3287  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  228  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  1.57529e-09  decreased coverage  5.79661e-07 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2940  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  228  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  1.58675e-06  hitchhiker  3.86502e-06 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3009  50S ribosomal protein L14  92.62 
 
 
122 aa  228  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000263087  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3939  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  225  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3432  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  224  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0231126  normal  0.198765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0289  50S ribosomal protein L14  89.34 
 
 
122 aa  222  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  1.11281e-09  hitchhiker  1.95891e-06 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0391  50S ribosomal protein L14  87.7 
 
 
122 aa  221  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0304428  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2315  50S ribosomal protein L14  88.52 
 
 
122 aa  221  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00156512  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0383  50S ribosomal protein L14  87.7 
 
 
122 aa  221  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  3.37556e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3328  ribosomal protein L14  87.7 
 
 
122 aa  221  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  9.64027e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  221  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1032  ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  219  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4233  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  219  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  9.45972e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0063  50S ribosomal protein L14  87.7 
 
 
122 aa  219  1e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  8.10078e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0329  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  219  1e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.5842e-28  unclonable  4.45572e-08 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0060  50S ribosomal protein L14  87.7 
 
 
122 aa  218  1e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  1.71332e-14  hitchhiker  1.54022e-17 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0330  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  218  2e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  1.52451e-08  hitchhiker  0.00105962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0611  50S ribosomal protein L14  86.07 
 
 
122 aa  218  2e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00801409  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0485  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  218  2e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.17206e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  85.25 
 
 
122 aa  218  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  1.1877e-07  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0777  ribosomal protein L14  86.89 
 
 
122 aa  216  8e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  3.94728e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  212  1e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3899  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  210  5e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00304511  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08950  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  209  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.459474  normal  0.0351235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0494  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0424686  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0497  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  3.05715e-05  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0636  ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  3.79152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5069  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.72755e-14  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0464  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825158  hitchhiker  2.7231e-06 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4538  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.118021 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0443  50S ribosomal protein L14  83.61 
 
 
122 aa  208  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00471045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0504  50S ribosomal protein L14  84.43 
 
 
122 aa  208  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0466171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2362  ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  208  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.956656  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0847  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  207  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.226508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0507  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  207  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  hitchhiker  2.90326e-10 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0337  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  207  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0848  ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  207  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4739  50S ribosomal protein L14  82.79 
 
 
122 aa  206  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0254345  normal  0.940147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04511  50S ribosomal protein L14  86.44 
 
 
119 aa  206  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00805091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0333  ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  205  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  4.13124e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0729  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 
122 aa  204  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0102983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0305  ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  202  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2314  50S ribosomal protein L14P  77.87 
 
 
122 aa  201  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109714  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2314  ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  201  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  2.8271e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0969  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  201  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.61836e-05  hitchhiker  1.00945e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0209  50S ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  199  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  7.83704e-08  hitchhiker  1.3297e-09 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06350  50S ribosomal protein L14  85.22 
 
 
116 aa  199  1e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131493  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0204  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  198  2e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.38487e-07  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0223  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  199  2e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.01155e-09  unclonable  7.31174e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0209  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  198  2e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.78183e-08  unclonable  1.39083e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0210  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  198  2e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.95848e-09  unclonable  8.19027e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3749  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  198  2e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.23635e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0206  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  198  2e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.5278e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0241  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  198  2e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4046  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  198  2e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.76442e-07  unclonable  3.58198e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4160  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  198  2e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.82968e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00948  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  199  2e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  6.86211e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4266  ribosomal protein L14  80.33 
 
 
122 aa  198  2e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  8.98489e-08  unclonable  3.02699e-12 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0168  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  197  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.80121e-09  hitchhiker  0.000304102 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0194  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 
122 aa  197  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.68914e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3504  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.79404e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0403  ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.77059e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03161  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.2346e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03112  hypothetical protein  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.01498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3793  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.02045e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0403  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  1.32736e-07  hitchhiker  7.17726e-05 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3605  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.64384e-09  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3695  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.88942e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4633  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  196  1e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.83604e-07  normal  0.378647 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0070  50S ribosomal protein L14  78.05 
 
 
123 aa  195  2e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  1.46326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0415  50S ribosomal protein L14  77.24 
 
 
123 aa  195  2e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0110237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3514  ribosomal protein L14  77.87 
 
 
122 aa  195  2e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  9.71398e-07  hitchhiker  9.93182e-08 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0180  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.57275e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0611  ribosomal protein L14  77.05 
 
 
122 aa  194  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0109418  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0499  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  194  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  1.01997e-08  decreased coverage  0.00104649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0494  50S ribosomal protein L14  78.69 
 
 
122 aa  194  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  5.12994e-07  normal  0.0255755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3904  50S ribosomal protein L14  77.24 
 
 
123 aa  194  4e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.92566e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0593  50S ribosomal protein L14  77.24 
 
 
123 aa  194  4e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.94944e-09  normal  0.41091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0293  50S ribosomal protein L14  77.24 
 
 
123 aa  194  4e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.13985e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  74.59 
 
 
122 aa  194  4e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>