59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0250 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0233  GDSL family lipase  84.56 
 
 		 421 aa  688    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000340097  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3430  lipolytic protein  87.71 
 
 		 423 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000013234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2775  lipolytic enzyme, G-D-S-L  88.84 
 
 		 421 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000857041  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0259  GDSL family lipase  96.22 
 
 		 423 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000511681  normal  0.138993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0250  GDSL family lipase  100 
 
 		 421 aa  832    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000480307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0311  GDSL family lipase  88.36 
 
 		 421 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000971594  hitchhiker  0.00755719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0331  GDSL family lipase  88.84 
 
 		 421 aa  689    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3096  lipase/acylhydrolase, putative  71.25 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2571  lipase/acylhydrolase, putative  71.28 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000716305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3539  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  71.28 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000245982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1986  putative lipase/acylhydrolase  71.28 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000018938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3110  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  71.28 
 
 		 483 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.000000000002324  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0013  lipolytic enzyme, G-D-S-L  71.28 
 
 		 483 aa  557  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0006  lipase/acylhydrolase, putative  71.28 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000023586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3835  GDSL-like lipase/acylhydrolase domain-containing protein  70.93 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00947114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2856  GDSL family lipase  63.68 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000379569  hitchhiker  0.00852131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0297  lipase/acylhydrolase  65.47 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3660  lipolytic protein G-D-S-L family  65.66 
 
 		 422 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000531698  hitchhiker  0.0000015866 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3774  lipolytic enzyme, G-D-S-L  70.9 
 
 		 384 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000241856  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2273  lipolytic protein G-D-S-L family  37.65 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0961  GDSL family lipase  41.29 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23690  putative secreted protein  41.87 
 
 		 442 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00903335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2556  lipolytic protein G-D-S-L family  41.62 
 
 		 414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2328  lipolytic protein G-D-S-L family  39.33 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  0.694344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14350  lysophospholipase L1-like esterase  39.56 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1595  lipolytic protein G-D-S-L family  38.64 
 
 		 418 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1245  lipolytic protein G-D-S-L family  39 
 
 		 414 aa  222  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20820  Lipolytic enzyme, G-D-S-L domain protein  39.29 
 
 		 451 aa  221  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1244  lipolytic protein G-D-S-L family  38.81 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2528  GDSL family lipase  38.74 
 
 		 437 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  36.45 
 
 		 542 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2643  lipolytic protein G-D-S-L family  37.31 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624519  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4719  lipolytic protein G-D-S-L family  39.1 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1831  GDSL family lipase  39.21 
 
 		 418 aa  206  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0423469 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3984  lipolytic protein G-D-S-L family  37.27 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.767273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3482  lipolytic protein G-D-S-L family  38.31 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3061  GDSL family lipase  37.47 
 
 		 415 aa  202  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.011325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1567  GDSL-like lipase/acylhydrolase family protein  38.18 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2776  lipolytic protein G-D-S-L family  35.32 
 
 		 487 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0775  lipolytic protein G-D-S-L family  35.9 
 
 		 646 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3879  GDSL family lipase  32.57 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4791  lipolytic protein G-D-S-L family  37.77 
 
 		 422 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0964  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.42 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4444  lipolytic protein G-D-S-L family  34.25 
 
 		 794 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2481  GDSL family lipase  33.86 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7004  GDSL family lipase  36.43 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2664  GDSL family lipase  31.8 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  decreased coverage  0.0000514586 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09287  extracellular GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00820)  31.19 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2832  lipolytic protein G-D-S-L family  31.78 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000255461  decreased coverage  0.0000190518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2070  lipolytic protein G-D-S-L family  32.88 
 
 		 395 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.397214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4331  hypothetical protein  33.96 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0237  hypothetical protein  26.1 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3614  lipolytic protein G-D-S-L family  39.82 
 
 		 220 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2838  lipolytic protein G-D-S-L family  28.54 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.902078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6408  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1375 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3773  lipolytic enzyme, G-D-S-L  72.97 
 
 		 37 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000131726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0724  putative lipase  26.27 
 
 		 573 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0740  alpha/beta hydrolase fold family protein  24.58 
 
 		 573 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0142196  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  31.39 
 
 		 209 aa  43.5  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>