72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0209 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0454  hypothetical protein  56.17 
 
 		 733 aa  820    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0142365  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0209  hypothetical protein  100 
 
 		 726 aa  1511    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16796  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1512  hypothetical protein  45.51 
 
 		 768 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  39.41 
 
 		 791 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04765  hypothetical protein  35.97 
 
 		 802 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1795  hypothetical protein  29.93 
 
 		 815 aa  192  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04689  hypothetical protein  31.12 
 
 		 740 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0313625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21490  hypothetical protein  34.53 
 
 		 882 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.680315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02034  hypothetical protein  34.79 
 
 		 720 aa  168  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  29.88 
 
 		 530 aa  151  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2698  hypothetical protein  38.8 
 
 		 800 aa  149  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  34.52 
 
 		 539 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1609  hypothetical protein  41.83 
 
 		 769 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186349  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1768  hypothetical protein  41.83 
 
 		 802 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1584  hypothetical protein  41.83 
 
 		 769 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2701  hypothetical protein  41.83 
 
 		 802 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  27.85 
 
 		 577 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  27.85 
 
 		 577 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  27.85 
 
 		 577 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  38.82 
 
 		 308 aa  108  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2165  hypothetical protein  27.63 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3320  hypothetical protein  25.31 
 
 		 670 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02032  hypothetical protein  29.29 
 
 		 299 aa  87.4  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  27.99 
 
 		 963 aa  87  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2626  hypothetical protein  28.27 
 
 		 753 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0479  hypothetical protein  28.27 
 
 		 753 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  27.22 
 
 		 960 aa  80.5  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  28.65 
 
 		 969 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  33.55 
 
 		 686 aa  77.4  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0415  hypothetical protein  26.07 
 
 		 764 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.762934 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  37.42 
 
 		 675 aa  71.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1593  rhs element Vgr protein  28.53 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000136682 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  27.02 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  27.12 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3887  Rhs element Vgr protein  27.48 
 
 		 615 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.360561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2919  hypothetical protein  26.5 
 
 		 764 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3479  hypothetical protein  25.29 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.928514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  30 
 
 		 1892 aa  63.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  25.08 
 
 		 436 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  26.24 
 
 		 456 aa  62  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1565  hypothetical protein  25.57 
 
 		 436 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  30.81 
 
 		 1338 aa  61.6  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3260  hypothetical protein  29.56 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  25.72 
 
 		 367 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  27.68 
 
 		 349 aa  60.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0711  hypothetical protein  28.4 
 
 		 698 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  30.67 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5597  Rhs element Vgr protein  24.77 
 
 		 1118 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  28.42 
 
 		 341 aa  55.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3334  hypothetical protein  28.92 
 
 		 513 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  28.37 
 
 		 367 aa  52.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  32.2 
 
 		 416 aa  52.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0814  rhs element Vgr protein  30 
 
 		 485 aa  52.4  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  52  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  23.51 
 
 		 424 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  51.2  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  27.91 
 
 		 393 aa  50.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  24.4 
 
 		 345 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  24.4 
 
 		 345 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  32 
 
 		 345 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  31.72 
 
 		 777 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  26.18 
 
 		 357 aa  48.1  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  28.03 
 
 		 427 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  26.59 
 
 		 523 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  28.18 
 
 		 347 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  25.74 
 
 		 345 aa  45.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  23.82 
 
 		 406 aa  45.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  24.54 
 
 		 411 aa  43.9  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>