221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0155 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  98.31 
 
 		 473 aa  861    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 		 475 aa  883    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  71.4 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  57.2 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  52.94 
 
 		 505 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  52.74 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  50.89 
 
 		 500 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  52.45 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  52.45 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  52.24 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  48.3 
 
 		 500 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  49.59 
 
 		 502 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  47.45 
 
 		 504 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  47.45 
 
 		 504 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  47.36 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  40.58 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  40.58 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  40.58 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  40.58 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  40.58 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  40.58 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  40.39 
 
 		 507 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  40.51 
 
 		 513 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  49.8 
 
 		 508 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  48.43 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  48.24 
 
 		 506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  48.24 
 
 		 506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  48.24 
 
 		 506 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3449  flagellar hook-associated protein 2  48.24 
 
 		 506 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0369122  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1670  flagellar hook-associated protein 2  48.24 
 
 		 506 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  48.24 
 
 		 506 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  37.95 
 
 		 468 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.27 
 
 		 455 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  39.39 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  34.41 
 
 		 454 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.45 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.76 
 
 		 456 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.12 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  36.32 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.28 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.76 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.82 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.1 
 
 		 454 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.68 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.59 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.1 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.24 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  38.13 
 
 		 490 aa  197  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.92 
 
 		 454 aa  192  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  33.64 
 
 		 454 aa  191  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  31.72 
 
 		 458 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  31.77 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  31.77 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  34.07 
 
 		 458 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.75 
 
 		 477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  35.64 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.56 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  33.04 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  29.83 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 476 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  30.44 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  30.9 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  31.22 
 
 		 474 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.26 
 
 		 482 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  33.82 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  30.9 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  30.33 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  30.33 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  30.33 
 
 		 467 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  29.46 
 
 		 487 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  34.18 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  27.11 
 
 		 478 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  32.91 
 
 		 484 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.45 
 
 		 487 aa  153  7e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  33.59 
 
 		 677 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  33.33 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  33.33 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.82 
 
 		 472 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  33.63 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  33.12 
 
 		 466 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  33.75 
 
 		 668 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  31.26 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  33.55 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.55 
 
 		 468 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  33.55 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  33.55 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  33.55 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  31.03 
 
 		 781 aa  143  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  32.7 
 
 		 471 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.63 
 
 		 499 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 448 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  26.62 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  32.52 
 
 		 487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  32.47 
 
 		 669 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.73 
 
 		 448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  31.82 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.02 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>