More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0152 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  47.97 
 
 
754 aa  680  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
828 aa  1681  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  76.67 
 
 
828 aa  1290  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  48.3 
 
 
789 aa  717  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  51.52 
 
 
824 aa  764  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  66.26 
 
 
833 aa  1033  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  98.55 
 
 
828 aa  1661  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  56.72 
 
 
732 aa  728  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  66.38 
 
 
833 aa  1025  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  48.09 
 
 
754 aa  671  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  49.65 
 
 
598 aa  506  1e-142  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  49.48 
 
 
708 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  50.53 
 
 
619 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  50.7 
 
 
595 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  46.7 
 
 
626 aa  492  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
789 aa  405  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 
909 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.35 
 
 
816 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
718 aa  329  1e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.59 
 
 
589 aa  321  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
1106 aa  320  9e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.89 
 
 
589 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  34.32 
 
 
1714 aa  318  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
4489 aa  315  3e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
3035 aa  313  9e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  33.28 
 
 
1221 aa  310  6e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
1094 aa  310  7e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.37 
 
 
739 aa  309  2e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
1106 aa  306  1e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.68 
 
 
739 aa  303  8e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 
796 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
808 aa  302  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  34.73 
 
 
717 aa  301  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
717 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  34.71 
 
 
797 aa  296  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.87 
 
 
937 aa  295  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  33.57 
 
 
596 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
713 aa  288  3e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.97 
 
 
740 aa  288  3e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 
968 aa  288  3e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  31.89 
 
 
1415 aa  287  6e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
776 aa  287  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
734 aa  286  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 
776 aa  286  1e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 
821 aa  286  1e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 
776 aa  286  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  34.47 
 
 
776 aa  286  1e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  34.29 
 
 
821 aa  286  1e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 
776 aa  285  3e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.7 
 
 
739 aa  284  6e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  29.49 
 
 
699 aa  283  8e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  36.47 
 
 
585 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.4 
 
 
781 aa  280  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.62 
 
 
667 aa  280  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
3560 aa  276  1e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 
790 aa  275  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.06 
 
 
708 aa  274  6e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
750 aa  274  6e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
780 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  30.49 
 
 
780 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.14 
 
 
715 aa  271  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.07 
 
 
790 aa  270  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 
633 aa  266  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.91 
 
 
723 aa  265  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.77 
 
 
742 aa  265  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  31 
 
 
733 aa  264  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 
727 aa  263  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  28.84 
 
 
822 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
1085 aa  258  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
627 aa  256  1e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 
779 aa  255  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 
700 aa  253  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.52 
 
 
529 aa  245  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 
693 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 
761 aa  238  3e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
1143 aa  237  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 
633 aa  235  2e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  29.78 
 
 
921 aa  236  2e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 
706 aa  231  4e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.72 
 
 
1116 aa  230  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
739 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  28.72 
 
 
1144 aa  227  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  34.59 
 
 
552 aa  225  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.84 
 
 
793 aa  223  1e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  34.65 
 
 
667 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 
878 aa  221  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.01 
 
 
810 aa  220  9e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
654 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
974 aa  213  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 
750 aa  212  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.82 
 
 
1154 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 
647 aa  206  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
632 aa  203  1e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
732 aa  202  2e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 
574 aa  202  2e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
740 aa  199  2e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  33.58 
 
 
492 aa  199  2e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 
681 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  27.18 
 
 
680 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  31.71 
 
 
553 aa  194  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>