More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0151 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  61.96 
 
 
828 aa  956  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  96.28 
 
 
833 aa  1533  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  68.02 
 
 
732 aa  911  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  66.14 
 
 
828 aa  1055  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  52.85 
 
 
824 aa  798  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  49.82 
 
 
789 aa  729  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  66.51 
 
 
828 aa  1058  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
833 aa  1662  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  47.09 
 
 
754 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  46.68 
 
 
754 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  47.83 
 
 
708 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  49.83 
 
 
598 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  49.91 
 
 
619 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  49.83 
 
 
595 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  46.92 
 
 
626 aa  475  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 
789 aa  400  1e-110  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 
909 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.27 
 
 
816 aa  342  2e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
968 aa  322  2e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 
1094 aa  322  2e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
718 aa  313  7e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.58 
 
 
1106 aa  310  8e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  34.04 
 
 
596 aa  305  2e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 
1714 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
3035 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.54 
 
 
739 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
717 aa  298  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.49 
 
 
589 aa  298  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31 
 
 
708 aa  297  7e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 
717 aa  296  9e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
1106 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.78 
 
 
589 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  31.35 
 
 
1221 aa  288  3e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  36.9 
 
 
585 aa  286  1e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.92 
 
 
739 aa  283  7e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.36 
 
 
667 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  31.71 
 
 
937 aa  281  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 
808 aa  280  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.44 
 
 
713 aa  279  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
750 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
796 aa  277  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.28 
 
 
699 aa  276  1e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.67 
 
 
739 aa  276  1e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  31.69 
 
 
1415 aa  270  6e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
4489 aa  270  6e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 
693 aa  270  8e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
633 aa  270  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.24 
 
 
723 aa  267  6e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
734 aa  266  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
3560 aa  265  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.09 
 
 
742 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.01 
 
 
740 aa  260  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
1085 aa  258  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  31.76 
 
 
780 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
780 aa  258  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  31.71 
 
 
781 aa  256  1e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
1143 aa  256  1e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
776 aa  254  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  32.79 
 
 
797 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
822 aa  253  9e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
627 aa  250  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.86 
 
 
529 aa  249  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.39 
 
 
715 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  30.75 
 
 
779 aa  247  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
776 aa  244  4e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  30.34 
 
 
821 aa  244  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  30.51 
 
 
821 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  30.51 
 
 
776 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  30.51 
 
 
776 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  30.51 
 
 
776 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
727 aa  241  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
733 aa  241  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.3 
 
 
790 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
633 aa  238  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.9 
 
 
1116 aa  235  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 
700 aa  235  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.27 
 
 
790 aa  231  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  33.78 
 
 
921 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 
1144 aa  223  2e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 
878 aa  221  4e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  35.68 
 
 
552 aa  220  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
706 aa  219  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 
793 aa  215  3e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.86 
 
 
810 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.14 
 
 
1154 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 
667 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
647 aa  209  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 
654 aa  207  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
739 aa  204  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  37.99 
 
 
681 aa  203  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
732 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
974 aa  195  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
750 aa  195  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
740 aa  194  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
761 aa  192  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
724 aa  191  3e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 
632 aa  192  3e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.17 
 
 
764 aa  192  3e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.2 
 
 
726 aa  191  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  32.6 
 
 
492 aa  190  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>