294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0105 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0105  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6039  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  54.33 
 
 		 210 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.126863 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5675  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  54.33 
 
 		 210 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6529  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.59 
 
 		 210 aa  227  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7470  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  56.08 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4826  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.15 
 
 		 210 aa  207  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5382  acyl carrier protein phosphodiesterase, putative  46.6 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.71 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0754  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.69 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665769  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4802  putative (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase (ACP phosphodiesterase)  39.9 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1236  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.57 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2250  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.45 
 
 		 210 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.488549  normal  0.224551 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  36.97 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1846  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.44 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0747958  normal  0.1639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  35.55 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  35.55 
 
 		 211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  34.03 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  34.03 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  34.03 
 
 		 201 aa  118  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  35.55 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  35.55 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  35.55 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  33.01 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  35.55 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  35.55 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  33.65 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  35.07 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  35.07 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.18 
 
 		 232 aa  114  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3492  azoreductase  34.43 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  33.33 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  33.51 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  33.51 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  33.51 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  33.51 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  33.51 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  36.27 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  32.98 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  32.98 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  32.98 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.98 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  32.98 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  32.98 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  32.06 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  32.98 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  31.43 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  32.98 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  32.98 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  32.98 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  35.41 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.78 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  31.9 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1788  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.31 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.37 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3430  azoreductase  30.98 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000541097  hitchhiker  0.0000000234591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1914  azoreductase  30.98 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000230252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1478  azoreductase  31.52 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5539  azoreductase  30.43 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5418  azoreductase  30.43 
 
 		 208 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1750  azoreductase  30.98 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24715e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1728  azoreductase  30.98 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5534  azoreductase  30.43 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1944  azoreductase  30.98 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4960600000000002e-30 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.5 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.39 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1993  azoreductase  30.98 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000776561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5505  azoreductase  29.89 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1770  azoreductase  30.98 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000243182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5262  azoreductase  29.89 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000325638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.37 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5090  azoreductase  29.89 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5107  azoreductase  30.43 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0384145  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.04 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5590  azoreductase  29.89 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1908  azoreductase  30.98 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5660  azoreductase  29.89 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.883174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  33.83 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5204  azoreductase  29.89 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.43 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.44 
 
 		 202 aa  99.4  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.55 
 
 		 199 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 		 208 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  32.43 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 		 198 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0202  azoreductase  29.89 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0196  azoreductase  29.89 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0203281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  36.13 
 
 		 211 aa  98.2  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  33.66 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  31.55 
 
 		 200 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1069  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 		 201 aa  98.2  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0133696  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.49 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.92 
 
 		 199 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1772  azoreductase  29.35 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000156707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0793  flavodoxin family protein  31.43 
 
 		 198 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0777  acyl carrier protein phosphodiesterase  31.43 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>