More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0075 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0075  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0086  ABC transporter related  100 
 
 
251 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610645  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0102  ABC transporter related  96.41 
 
 
251 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2971  ABC transporter related  96.41 
 
 
251 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0084  ABC transporter related  96.41 
 
 
251 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0084  ABC transporter related  95.62 
 
 
251 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3266  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  93.23 
 
 
251 aa  477  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  86.85 
 
 
251 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0199  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding subunit  86.85 
 
 
251 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3330  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  87.65 
 
 
251 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3376  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  86.85 
 
 
251 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4066  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  86.85 
 
 
251 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1608  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  86.85 
 
 
251 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2993  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  86.85 
 
 
251 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399368  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3914  ABC transporter related  83.06 
 
 
252 aa  421  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3048  ABC transporter related  83.47 
 
 
251 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0018  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  82.26 
 
 
252 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  81.78 
 
 
239 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3370  ABC transporter related  81.09 
 
 
241 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3121  ABC transporter related  79.24 
 
 
237 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3519  ABC transporter-related protein  79.92 
 
 
241 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1281  ABC transporter-related protein  79.24 
 
 
237 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  0.295015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3538  ABC transporter related  79.1 
 
 
246 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0777529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3212  ABC transporter related  79.1 
 
 
246 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2467  ABC transporter related  79.24 
 
 
237 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.766044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3343  ABC transporter ATP-binding protein  79.1 
 
 
246 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5163  ABC transporter related  79.83 
 
 
236 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.726387  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4074  ABC transporter related  77.54 
 
 
241 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3486  ABC transporter related  77.22 
 
 
238 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.265059  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3781  ABC transporter related  73.77 
 
 
245 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3755  ABC transporter ATP-binding protein  77.25 
 
 
237 aa  349  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  73.28 
 
 
247 aa  348  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1076  ABC transporter related  74.03 
 
 
234 aa  346  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000101179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  74.03 
 
 
234 aa  343  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  72.73 
 
 
234 aa  340  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6435  ABC transporter related  70.94 
 
 
234 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  66.39 
 
 
239 aa  315  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1678  ABC transporter related  66.23 
 
 
239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0007  ABC transporter related  64.96 
 
 
234 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0678223 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0007  ABC transporter related  66.38 
 
 
234 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1821  ABC transporter related  67.53 
 
 
243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  64.94 
 
 
240 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2136  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  67.53 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  62.23 
 
 
244 aa  298  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  62.23 
 
 
244 aa  297  9e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  60.61 
 
 
251 aa  297  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  60.94 
 
 
233 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  58.47 
 
 
248 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  59.75 
 
 
239 aa  293  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  61.9 
 
 
246 aa  291  6e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2954  ABC transporter related  58.05 
 
 
254 aa  291  6e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3756  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  57.14 
 
 
248 aa  291  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  61.04 
 
 
232 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  60.61 
 
 
232 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  60.94 
 
 
234 aa  290  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  57.63 
 
 
248 aa  289  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  57.2 
 
 
248 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  60.52 
 
 
246 aa  288  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0955  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF, putative  58.9 
 
 
241 aa  288  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  59.31 
 
 
232 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6727  ABC transporter related  58.87 
 
 
233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  59.66 
 
 
242 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0896  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein LivF  58.47 
 
 
241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.54469  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5821  ABC transporter related  58.87 
 
 
233 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.602049  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  59.32 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  58.87 
 
 
230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  58.44 
 
 
236 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0937  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  54.98 
 
 
240 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476932  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  51.83 
 
 
230 aa  236  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  50.85 
 
 
246 aa  224  1e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  48.94 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  49.36 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1802  ABC transporter related  46.32 
 
 
230 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.639319  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  49.18 
 
 
259 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2808  ABC transporter related  48.48 
 
 
232 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  49.58 
 
 
259 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1792  ABC transporter related  45.45 
 
 
230 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519176 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
238 aa  202  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.75 
 
 
232 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  46.15 
 
 
234 aa  201  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  45.89 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.47 
 
 
234 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  46.79 
 
 
231 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  46.79 
 
 
231 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  47.68 
 
 
536 aa  197  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.79 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  43.78 
 
 
237 aa  195  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  45.92 
 
 
236 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  46.26 
 
 
237 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  46.64 
 
 
237 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.73 
 
 
237 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 
237 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  46.19 
 
 
231 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.07 
 
 
239 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.73 
 
 
237 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 
234 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  45.09 
 
 
244 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.75 
 
 
234 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 
239 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3803  ABC transporter related  44.49 
 
 
234 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>