45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0043 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0053  general secretion pathway protein L  99.12 
 
 		 456 aa  884    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0324738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0072  general secretion pathway protein L  90.35 
 
 		 457 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.73764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0054  general secretion pathway protein L  85.01 
 
 		 468 aa  723    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3235  general secretion pathway L protein  88.18 
 
 		 453 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0017  general secretion pathway L  90.13 
 
 		 457 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00266304  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0043  general secretion pathway protein L  100 
 
 		 456 aa  890    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0053  general secretion pathway protein L  90.13 
 
 		 457 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2671  general secretory pathway protein L  69.44 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.347671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0017  general secretion pathway protein L  69.44 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0017  general secretion pathway protein L  68.8 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1881  general secretory pathway protein L  69.44 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3509  general secretory pathway protein L  69.44 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0016  general secretion pathway protein L (GspL)  70.68 
 
 		 456 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2776  general secretory pathway protein L  68.98 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0229  general secretion pathway protein L  68.98 
 
 		 462 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4492  putative general secretory pathway protein L  59.2 
 
 		 475 aa  518  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3945  general secretion pathway protein L  59.54 
 
 		 475 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3079  general secretion pathway protein L  59.57 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.984661  hitchhiker  0.000000407106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3226  general secretion pathway L  37.25 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.448887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3389  general secretion pathway L  34.46 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3049  General secretion pathway L  35.1 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.833008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3111  general secretory pathway L transmembrane protein  41.67 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3396  General secretion pathway L  41.5 
 
 		 476 aa  94.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5694  general secretion pathway L  27.8 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1326  hypothetical protein  29.79 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0920  hypothetical protein  28.04 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116289  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3424  general secretion pathway L  34.59 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000831438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3133  general secretion pathway protein L  32.58 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1893  general secretion pathway L  26.43 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.747419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  31.15 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3526  general secretion pathway L  30.92 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  26.15 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4827  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0670  general secretion pathway L  35.04 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0649  General secretion pathway L  35.04 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.01067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1076  General secretion pathway L  36.36 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  29.73 
 
 		 381 aa  46.6  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  27 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1356  general secretion pathway protein L  24.63 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  36.96 
 
 		 382 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  25.57 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  38.54 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  36.22 
 
 		 412 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0759  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.777484  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  26.61 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>