51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0042 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 168 aa  336  9e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  99.4 
 
 		 168 aa  334  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  90.48 
 
 		 168 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  90.48 
 
 		 168 aa  308  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  88.69 
 
 		 168 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  88.69 
 
 		 168 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  86.9 
 
 		 168 aa  296  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  77.38 
 
 		 168 aa  265  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  76.79 
 
 		 168 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  76.79 
 
 		 168 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  76.79 
 
 		 175 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  76.19 
 
 		 168 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  76.19 
 
 		 168 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  76.19 
 
 		 168 aa  263  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  76.19 
 
 		 175 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  72.02 
 
 		 167 aa  246  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  72.02 
 
 		 167 aa  245  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  70.24 
 
 		 167 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  39.38 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  40.13 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  39.87 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  40.4 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  39.74 
 
 		 189 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  28 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  33.54 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1892  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  26.03 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55460  type II secretion system protein  28.87 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000029628  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  25.34 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  30.41 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  24.6 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  24.6 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  26.5 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  24.6 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  24.6 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  25.58 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  25 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  25.4 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  25.64 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  26.5 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  24.67 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  23.65 
 
 		 158 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  25.64 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  24.79 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  27.2 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  25.81 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  24.18 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  23.9 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  25.97 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  25.97 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>