172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0026 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  97.01 
 
 		 334 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  97.31 
 
 		 334 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 334 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  97.31 
 
 		 334 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  99.7 
 
 		 334 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  95.81 
 
 		 334 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  94.61 
 
 		 334 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  86.94 
 
 		 337 aa  588  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  86.35 
 
 		 364 aa  584  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  86.65 
 
 		 337 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  86.35 
 
 		 337 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  86.65 
 
 		 337 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  86.65 
 
 		 337 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  86.65 
 
 		 337 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  86.65 
 
 		 337 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  82.3 
 
 		 339 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  82.3 
 
 		 339 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  76.29 
 
 		 336 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  75.79 
 
 		 356 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  62.46 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  62.15 
 
 		 349 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  59.69 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  61.49 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  62.38 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  61.26 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  64.36 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  64.69 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  62.17 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  62.05 
 
 		 303 aa  371  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  51.39 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  40.79 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  39.75 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  41.45 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  37.43 
 
 		 332 aa  219  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  36.97 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  36.67 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  36.63 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  39.29 
 
 		 376 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  37.83 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  37.83 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  35.95 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.52 
 
 		 344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.29 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.82 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  33.43 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  34.44 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  37.35 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  34.44 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  37.05 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 347 aa  188  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  37.17 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  36.63 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.3 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  33.44 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  34.29 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 361 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  31.16 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  32.99 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  30.26 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  31.53 
 
 		 340 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  27.55 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.57 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.57 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.1 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.54 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.41 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  28.27 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  28.99 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  28.99 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  28.04 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.04 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.99 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.99 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  28.99 
 
 		 325 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.79 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.74 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  24.8 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.53 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  25.55 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.23 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.193725  normal  0.38818 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5921  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.31 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0446712  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.45 
 
 		 347 aa  53.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  23.67 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  28.42 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  31.94 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.41 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  28.66 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  21.71 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  23.71 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  23.79 
 
 		 334 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.34 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4931  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.22 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4373  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 352 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.742305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  28.33 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  28.33 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>