More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0007 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  90.36 
 
 		 361 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  99.17 
 
 		 363 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  92.68 
 
 		 364 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  91.18 
 
 		 361 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  100 
 
 		 363 aa  728    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  91.18 
 
 		 361 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  91.71 
 
 		 363 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  78.95 
 
 		 361 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  78.39 
 
 		 361 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  79.05 
 
 		 361 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  79.05 
 
 		 361 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  63.58 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  56.33 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  56.63 
 
 		 362 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  53.94 
 
 		 350 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  53.03 
 
 		 350 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  50.58 
 
 		 350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  50.75 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  51.01 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  49.86 
 
 		 366 aa  328  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  50.6 
 
 		 357 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  50.85 
 
 		 370 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  52.2 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  49.68 
 
 		 353 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  48.18 
 
 		 353 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  47.45 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  45.24 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  46.57 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  42.47 
 
 		 367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  43.19 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  42.38 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  42.51 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  40.66 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  42.57 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  42.76 
 
 		 332 aa  238  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  37.82 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  39.87 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  39.38 
 
 		 338 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  37.2 
 
 		 329 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  38.82 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  35.97 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  36.76 
 
 		 328 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  37.17 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  36.3 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  36.18 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  35.43 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  33.99 
 
 		 332 aa  159  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  34.8 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  30 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.94 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  33.56 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  33.88 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  33.33 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  32.17 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  32.75 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  30.85 
 
 		 330 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  31.85 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.51 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  31.25 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  28.87 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  31.51 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  30.69 
 
 		 335 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1244  Catalase  30.19 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  28.33 
 
 		 529 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  31.09 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  29.1 
 
 		 552 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  29.63 
 
 		 675 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  28.43 
 
 		 529 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  29.8 
 
 		 705 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0570  putative catalase  27.95 
 
 		 695 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0605334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  28.28 
 
 		 695 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  27.3 
 
 		 552 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0560  catalase  26.94 
 
 		 695 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  29.14 
 
 		 704 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3261  Catalase  28.96 
 
 		 718 aa  93.6  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  0.0386597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  28.66 
 
 		 499 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  28.24 
 
 		 848 aa  93.2  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  27.42 
 
 		 554 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  29.43 
 
 		 693 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  28.76 
 
 		 801 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  29.33 
 
 		 702 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  28.43 
 
 		 718 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  27.52 
 
 		 529 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2453  catalase  28.15 
 
 		 724 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956012  normal  0.127715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  29.33 
 
 		 702 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4790  catalase  29.1 
 
 		 704 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  30.51 
 
 		 493 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  28.38 
 
 		 709 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  27.4 
 
 		 504 aa  90.9  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  28.48 
 
 		 543 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2220  catalase  27.12 
 
 		 459 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000397232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0222  Catalase  29.9 
 
 		 484 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  28.43 
 
 		 705 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  27.42 
 
 		 529 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  27.67 
 
 		 555 aa  90.1  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  26.26 
 
 		 711 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  27.78 
 
 		 485 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3026  catalase  26.62 
 
 		 459 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0899  catalase  26.76 
 
 		 665 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  27.4 
 
 		 505 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>