78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6690 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 
173 aa  354  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  86.47 
 
 
173 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  69.01 
 
 
172 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  69.01 
 
 
172 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  69.01 
 
 
172 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  69.01 
 
 
172 aa  225  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  50.92 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  49.14 
 
 
185 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  47.85 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  49.67 
 
 
178 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  47.88 
 
 
190 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  48.05 
 
 
193 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  48.05 
 
 
193 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  47.06 
 
 
193 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  48.05 
 
 
193 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  47.06 
 
 
193 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  48.05 
 
 
193 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  48.7 
 
 
176 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.91 
 
 
173 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  46.41 
 
 
193 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.75 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.75 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  45.75 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.75 
 
 
164 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  40.79 
 
 
184 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  43.48 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  43.48 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  42.24 
 
 
182 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  42.24 
 
 
186 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  43.31 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.42 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.67 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.87 
 
 
159 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  39.87 
 
 
159 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  39.87 
 
 
159 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  37.75 
 
 
173 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.5 
 
 
191 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  37.25 
 
 
170 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  34.87 
 
 
191 aa  99  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.75 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  37.82 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  37.82 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  37.75 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  35.48 
 
 
248 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  26.62 
 
 
235 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  26.62 
 
 
235 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  31.65 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.65 
 
 
161 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  32.12 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.94 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.62 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.29 
 
 
147 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  32.29 
 
 
147 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  32.29 
 
 
147 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.94 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  30.94 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  30.94 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  30.94 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  31.39 
 
 
160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  31.88 
 
 
157 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  36.17 
 
 
165 aa  50.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.41 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.4 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  35.29 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  29.55 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  31.13 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  35.37 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>