155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6688 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  89.52 
 
 		 353 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  100 
 
 		 353 aa  721    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  80.94 
 
 		 349 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  80.83 
 
 		 349 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  80.94 
 
 		 349 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  80.94 
 
 		 349 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  56.64 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  55.05 
 
 		 370 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  54.77 
 
 		 362 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  55.8 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  55.8 
 
 		 331 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  54.37 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  59.43 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  59.43 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  59.43 
 
 		 361 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  54.86 
 
 		 331 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  56 
 
 		 351 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  59.12 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  59.12 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  59.12 
 
 		 361 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  49.85 
 
 		 341 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  56.47 
 
 		 358 aa  352  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  49.85 
 
 		 341 aa  352  8e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  49.85 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  56.03 
 
 		 311 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  53.85 
 
 		 358 aa  348  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  53.74 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  50.47 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  43.22 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  41.38 
 
 		 357 aa  248  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  40.25 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  42.81 
 
 		 427 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  39.23 
 
 		 488 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  41.36 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  44.22 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  40.13 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  41.72 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  41.72 
 
 		 348 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  39.86 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  36.96 
 
 		 492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  39.05 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  36.41 
 
 		 481 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  39.87 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  39.59 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  36.36 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.33 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.79 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  42.77 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  42.77 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  42.77 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  42.77 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.1 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.38 
 
 		 343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  30.69 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  29.57 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  30.91 
 
 		 356 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  30.77 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  30.3 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  30.3 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  30 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  33.45 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  28.25 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  28.25 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  28.25 
 
 		 327 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  30.84 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  30.53 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.24 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.6 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  29.1 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.74 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.32 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  28.69 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.78 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.78 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  28.69 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  28.69 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  28.93 
 
 		 366 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  26.39 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  24.58 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  29.03 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  29.17 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  28.35 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  24.92 
 
 		 332 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  23.93 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  25.56 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  28.77 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  26.15 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  25.91 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  28.42 
 
 		 338 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  24.64 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  29.29 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  27.13 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>