102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6687 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  696    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  82.49 
 
 		 352 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1619  ImpA-like N-terminal family protein  69.44 
 
 		 356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0148  ImpA-related N-terminal family protein  69.44 
 
 		 356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00537792  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  67.78 
 
 		 356 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0170  ImpA-related N-terminal family protein  69.44 
 
 		 356 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  45.24 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  43.06 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  45.35 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  40.75 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  44.73 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  42.37 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  41.09 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  40.82 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  42.69 
 
 		 345 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  42.69 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  42.69 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  42.69 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  43.27 
 
 		 367 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  42.69 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  42.49 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  40.51 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  34.7 
 
 		 397 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  34.7 
 
 		 397 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  40.28 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  40 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  34.22 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  40 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  30.23 
 
 		 346 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  28.15 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  29.24 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.89 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  30.14 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  29.62 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.33 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  29.89 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  29.6 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  29.89 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  29.89 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  29.6 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  29.89 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  34.67 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  28.57 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  28.95 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.47 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  32.74 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  27.49 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1589  ImpA-like  40.27 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.449163  normal  0.490012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  27.22 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  26.63 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1761  hypothetical protein  25.53 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0750  hypothetical protein  25.53 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1045  hypothetical protein  25.53 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855246  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2019  ImpA-related N-terminal family protein  25.53 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0788  ImpA-related N-terminal family protein  25.53 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0699  ImpA-related N-terminal family protein  25.53 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2073  hypothetical protein  25.15 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.530658  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  25.29 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  25.66 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.29 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  25.36 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.51 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  35.45 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  25.08 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0634  ImpA-like protein  34.26 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.217357 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  29.17 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  30.34 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  32.23 
 
 		 366 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  30.34 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  31.13 
 
 		 522 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  35.51 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  28.32 
 
 		 533 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  27.22 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  27.22 
 
 		 373 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  27.22 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  27.22 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  32.11 
 
 		 524 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  30.91 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  25.95 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1799  ImpA domain-containing protein  32.04 
 
 		 530 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.288057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  32.69 
 
 		 790 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  32.43 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  32.43 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  32.43 
 
 		 373 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.83 
 
 		 439 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  31.67 
 
 		 337 aa  49.7  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  32.04 
 
 		 789 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  27.13 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2492  ImpA domain-containing protein  30.1 
 
 		 533 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2990  ImpA domain-containing protein  30.1 
 
 		 533 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000813522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2590  type VI secretion-associated protein  30.1 
 
 		 533 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.47 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3656  type VI secretion-associated protein  30.56 
 
 		 527 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983598  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  31.07 
 
 		 528 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  34.31 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3721  ImpA domain-containing protein  25.93 
 
 		 482 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1208  ImpA domain-containing protein  24.27 
 
 		 469 aa  43.5  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>