98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6683 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 88 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  88.64 
 
 		 88 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0130  Rhs family protein  73.86 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904339  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0167  Rhs family protein  73.86 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.688933  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1614  Rhs family protein  73.86 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0144  PAAR motif-containing protein  73.86 
 
 		 91 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.352766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  45.65 
 
 		 855 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  44.57 
 
 		 1229 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  54.41 
 
 		 1386 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  43.02 
 
 		 1409 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  48.1 
 
 		 1419 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  43.02 
 
 		 1400 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  43.02 
 
 		 1385 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  42.31 
 
 		 1446 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  38.82 
 
 		 1379 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  38.71 
 
 		 1437 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1907  PAAR repeat-containing protein  40.22 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0142709  hitchhiker  0.000734481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  41.84 
 
 		 456 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  44.19 
 
 		 1140 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  47.06 
 
 		 1411 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  40 
 
 		 1447 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  45.33 
 
 		 386 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 461 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  46.05 
 
 		 1583 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  47.89 
 
 		 597 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  40.23 
 
 		 1410 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  32.56 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  37.35 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 406 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  38.54 
 
 		 1421 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  37.35 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  38.82 
 
 		 1422 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  40.82 
 
 		 456 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  40.21 
 
 		 592 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  35.63 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  38.82 
 
 		 1423 aa  50.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1043  hypothetical protein  43.33 
 
 		 92 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  40.54 
 
 		 1457 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  40.54 
 
 		 1475 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  41.76 
 
 		 469 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  38.89 
 
 		 1495 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  40 
 
 		 453 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  36.17 
 
 		 1359 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  40.91 
 
 		 540 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  45.16 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0734  GP29  37.14 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  41.49 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  36.67 
 
 		 466 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  39.19 
 
 		 1428 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1487 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 		 1494 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  37.5 
 
 		 1494 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  39.08 
 
 		 379 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  46.48 
 
 		 1604 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5383  PAAR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  39.19 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  42.67 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  39.53 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0925  PAAR repeat-containing protein  41.49 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1418 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  39.78 
 
 		 177 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1390 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  44.59 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  33.8 
 
 		 1517 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  40.54 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  40.54 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1402 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  39.19 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  39.19 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  39.19 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  39.19 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  34.52 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  34.72 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  37.8 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13390  hypothetical protein  39.56 
 
 		 131 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.694836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  39.19 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  39.19 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  41.76 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  42.86 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  41.1 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  40.66 
 
 		 481 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  39.19 
 
 		 87 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  38.16 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  32.89 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  35.06 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  34.18 
 
 		 89 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  38.03 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  36.46 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  44 
 
 		 1600 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  44 
 
 		 1505 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3756  hypothetical protein  40.91 
 
 		 386 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.136459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>