166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6679 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  42.92 
 
 		 1329 aa  1026    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1302 aa  2647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  44.57 
 
 		 1289 aa  994    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  44.6 
 
 		 1268 aa  1051    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  43.47 
 
 		 1348 aa  1067    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  44.57 
 
 		 1289 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  34.4 
 
 		 1150 aa  649    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  71.04 
 
 		 1302 aa  1878    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  43.82 
 
 		 1358 aa  979    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  34.37 
 
 		 1275 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  41.85 
 
 		 1369 aa  1014    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  39.46 
 
 		 1332 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  71.51 
 
 		 1302 aa  1868    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  43.04 
 
 		 1365 aa  1038    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  44.5 
 
 		 1289 aa  993    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  42.22 
 
 		 1365 aa  1035    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  38.96 
 
 		 1317 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  71.12 
 
 		 1302 aa  1879    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  43.9 
 
 		 1358 aa  983    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  42.65 
 
 		 1366 aa  989    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  71.04 
 
 		 1302 aa  1877    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  43.82 
 
 		 1358 aa  980    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  34.37 
 
 		 1275 aa  715    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  84.25 
 
 		 1302 aa  2239    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  44.57 
 
 		 1289 aa  994    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  34.15 
 
 		 1211 aa  635  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  34.55 
 
 		 1199 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  35.11 
 
 		 1208 aa  612  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  33.25 
 
 		 1209 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  34.24 
 
 		 1218 aa  609  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  34.64 
 
 		 1209 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  34.75 
 
 		 1205 aa  595  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  34.88 
 
 		 1209 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  34.88 
 
 		 1209 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  34.88 
 
 		 1209 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  34.63 
 
 		 1209 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  34.63 
 
 		 1209 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  34.88 
 
 		 1209 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  34.81 
 
 		 1209 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  32.2 
 
 		 1207 aa  546  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  41.37 
 
 		 890 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  41.37 
 
 		 890 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  32.64 
 
 		 1220 aa  535  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  31.06 
 
 		 1212 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  30.65 
 
 		 1171 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1176 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1102 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  27.73 
 
 		 1182 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  27.21 
 
 		 1172 aa  422  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  30.21 
 
 		 1175 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  49.16 
 
 		 431 aa  390  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  49.16 
 
 		 431 aa  390  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  28.25 
 
 		 1164 aa  386  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  30.15 
 
 		 1204 aa  365  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  27.51 
 
 		 1181 aa  360  8e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1181 aa  356  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  28.19 
 
 		 1176 aa  342  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1173 aa  340  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  28.88 
 
 		 1173 aa  335  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  27.04 
 
 		 1148 aa  308  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  27.18 
 
 		 1157 aa  307  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  24.77 
 
 		 1187 aa  295  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  27.64 
 
 		 1179 aa  295  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1192 aa  294  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  26.9 
 
 		 1152 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1208 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  25.24 
 
 		 1182 aa  282  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1179 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1175 aa  266  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1175 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  25.4 
 
 		 1206 aa  260  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1206 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1168 aa  251  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.04 
 
 		 1194 aa  249  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  24.83 
 
 		 1177 aa  246  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  24.83 
 
 		 1177 aa  246  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1164 aa  230  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  27.55 
 
 		 1164 aa  229  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  25 
 
 		 1165 aa  226  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  24.4 
 
 		 1165 aa  223  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1195 aa  219  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 1194 aa  220  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1008 aa  219  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  26.02 
 
 		 1205 aa  211  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1174 aa  210  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  23.64 
 
 		 1165 aa  209  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1174 aa  209  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1270 aa  207  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  24.28 
 
 		 1230 aa  203  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  33.6 
 
 		 1313 aa  193  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  26.3 
 
 		 1164 aa  194  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1167 aa  194  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1167 aa  194  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1167 aa  194  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1167 aa  194  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  25.06 
 
 		 1153 aa  193  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1147 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2090  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1104 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1153 aa  192  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0730  hypothetical protein  26.06 
 
 		 728 aa  189  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000967191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>