153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6677 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6677  type VI secretion protein  100 
 
 
449 aa  909    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1608  hypothetical protein  88.64 
 
 
480 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0125  hypothetical protein  88.86 
 
 
480 aa  814    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3024  type VI secretion protein  94.43 
 
 
449 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0161  hypothetical protein  88.64 
 
 
449 aa  811    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0138  hypothetical protein  88.64 
 
 
452 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0936  type VI secretion protein, VC_A0114 family  62.05 
 
 
447 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6110  type VI secretion protein  61.16 
 
 
448 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1483  type VI secretion protein  61.04 
 
 
449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2875  hypothetical protein  61.04 
 
 
449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1371  hypothetical protein  61.04 
 
 
449 aa  581  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0238  hypothetical protein  61.83 
 
 
448 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1913  hypothetical protein  61.38 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1691  hypothetical protein  61.38 
 
 
448 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.802444  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0926  hypothetical protein  61.38 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1213  hypothetical protein  61.38 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0329  hypothetical protein  61.61 
 
 
448 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2188  hypothetical protein  61.38 
 
 
448 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2089  putative temperature-dependent protein secretion, ImpJ  60.04 
 
 
448 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0984  hypothetical protein  57.81 
 
 
448 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1675  type VI secretion protein, VC_A0114 family  57.81 
 
 
447 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88528  hitchhiker  0.0077822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3478  hypothetical protein  57.81 
 
 
447 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.486884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0313  type VI secretion protein, family  57.02 
 
 
447 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.471816 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0319  type VI secretion protein, family  57.02 
 
 
447 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0302  hypothetical protein  57.02 
 
 
447 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.392469  normal  0.385972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0307  type VI secretion protein  57.02 
 
 
447 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300554  normal  0.0525484 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3913  type VI secretion protein  57.91 
 
 
416 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0211  type VI secretion protein, VC_A0114 family  42.44 
 
 
458 aa  347  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2318  hypothetical protein  38.93 
 
 
444 aa  330  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0487552  hitchhiker  0.00103904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0150  hypothetical protein  39.15 
 
 
444 aa  330  4e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00940  hypothetical protein  39.15 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0112579  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3844  type VI secretion protein  38.7 
 
 
444 aa  326  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0110826  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0514  type VI secretion protein, VC_A0114 family  38.62 
 
 
443 aa  318  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1471  hypothetical protein  40.04 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0560986  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1594  hypothetical protein  38.04 
 
 
472 aa  299  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26730  hypothetical protein  38.74 
 
 
455 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0252  hypothetical protein  37.06 
 
 
468 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2090  hypothetical protein  36.69 
 
 
443 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1207  ImpJ  36.7 
 
 
454 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.740729  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0397  hypothetical protein  36.7 
 
 
467 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0991372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1591  hypothetical protein  36.7 
 
 
467 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1776  hypothetical protein  36.7 
 
 
467 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2967  hypothetical protein  36.7 
 
 
467 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2842  hypothetical protein  36.7 
 
 
467 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0446  hypothetical protein  36.7 
 
 
467 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1203  hypothetical protein  36.04 
 
 
444 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.816844  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00252  ImpJ  37.42 
 
 
445 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2522  type VI secretion protein  33.93 
 
 
444 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.711445  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0102  hypothetical protein  36.4 
 
 
443 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6043  hypothetical protein  35.41 
 
 
446 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1524  hypothetical protein  32.14 
 
 
445 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3726  hypothetical protein  34.38 
 
 
444 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.529361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0239  hypothetical protein  35.06 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.892408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0231  hypothetical protein  34.83 
 
 
443 aa  266  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5420  hypothetical protein  34.61 
 
 
443 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.957862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0233  hypothetical protein  34.83 
 
 
443 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1077  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.71 
 
 
445 aa  263  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.414986  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5579  hypothetical protein  34.38 
 
 
443 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3248  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.71 
 
 
445 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4055  type VI secretion protein  35.86 
 
 
445 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000569036 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2800  type VI secretion protein, VC_A0114 family  35.71 
 
 
445 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2998  hypothetical protein  34.75 
 
 
448 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0393  type VI secretion protein  34.75 
 
 
448 aa  259  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0320  hypothetical protein  34.75 
 
 
448 aa  259  8e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000430  uncharacterized protein ImpJ/VasE  32.21 
 
 
441 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.959162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05852  hypothetical protein  32.44 
 
 
441 aa  256  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1223  hypothetical protein  33.93 
 
 
443 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.629455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1104  hypothetical protein  33.93 
 
 
443 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1115  putative type VI secretion protein VasE  32.66 
 
 
440 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2466  type VI secretion protein, VC_A0114 family  34.52 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3605  hypothetical protein  34.16 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42920  hypothetical protein  33.93 
 
 
443 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0052  hypothetical protein  34.15 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.808473  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3231  type VI secretion protein  34.89 
 
 
445 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3046  type VI secretion protein, VC_A0114 family  33.86 
 
 
445 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00998983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2375  hypothetical protein  31.17 
 
 
442 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3033  hypothetical protein  33.48 
 
 
443 aa  246  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0153643  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2617  hypothetical protein  35.56 
 
 
445 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500578  normal  0.0201893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2120  hypothetical protein  35.56 
 
 
445 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2354  type VI secretion protein, VC_A0114 family  32.29 
 
 
446 aa  232  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2552  hypothetical protein  32.95 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0100062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4080  hypothetical protein  33.93 
 
 
445 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365614  hitchhiker  0.000139294 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000014  uncharacterized protein ImpJ/VasE  29.43 
 
 
429 aa  209  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2451  hypothetical protein  29.6 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0187575  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1887  hypothetical protein  30.13 
 
 
453 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2088  hypothetical protein  29.91 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0852077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0803  hypothetical protein  29.91 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.533915  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0715  hypothetical protein  29.91 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147759  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0024  hypothetical protein  33.95 
 
 
301 aa  163  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.668164  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3552  type VI secretion protein  28.57 
 
 
451 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0196523  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3423  hypothetical protein  28.57 
 
 
451 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3485  hypothetical protein  29.52 
 
 
442 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.778826  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3129  hypothetical protein  29.52 
 
 
442 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000877531  normal  0.24855 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1181  putative type VI secretion protein VasE-1  23.09 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2264  hypothetical protein  24.44 
 
 
448 aa  126  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2771  type VI secretion protein  24.45 
 
 
447 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.171251  normal  0.625099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3093  hypothetical protein  24.67 
 
 
447 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.131309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2629  hypothetical protein  24.45 
 
 
447 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253477  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4960  hypothetical protein  24.67 
 
 
447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286001  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2967  hypothetical protein  25.49 
 
 
448 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>