135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6675 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  88.12 
 
 		 160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  88.75 
 
 		 160 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  87.5 
 
 		 160 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  87.5 
 
 		 160 aa  299  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  91.88 
 
 		 160 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  72.78 
 
 		 160 aa  247  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  74.68 
 
 		 161 aa  238  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  71.52 
 
 		 160 aa  222  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  68.35 
 
 		 161 aa  215  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  62.66 
 
 		 161 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  62.66 
 
 		 161 aa  213  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  62.66 
 
 		 161 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  63.29 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  66.46 
 
 		 161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  66.46 
 
 		 161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  66.46 
 
 		 161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  66.46 
 
 		 161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  66.46 
 
 		 161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  66.46 
 
 		 161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  66.46 
 
 		 161 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  62.66 
 
 		 161 aa  210  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  69.62 
 
 		 161 aa  210  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  68.99 
 
 		 161 aa  209  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  68.35 
 
 		 161 aa  207  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  56.33 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  56.33 
 
 		 161 aa  190  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  56.33 
 
 		 161 aa  190  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  63.12 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  62.5 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  53.85 
 
 		 155 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  54.72 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  58.6 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  49.38 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  57.98 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  48.1 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  46.84 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  46.58 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  47.83 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  47.2 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  40.51 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  42.31 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  42.5 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  38.12 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  38.75 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  37.97 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  40.12 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  33.77 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  37.04 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  36.42 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  38.03 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  35 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.03 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  33.94 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  33.94 
 
 		 172 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  34.15 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  40.14 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  32.68 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  33.53 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  35.66 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34030  hypothetical protein  34.87 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142054  normal  0.0892897 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  35.66 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2894  hypothetical protein  34.87 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3375  hypothetical protein  32.05 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.693838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  28.85 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  32.74 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3382  putative cytoplasmic protein  32.03 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.963871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3476  hypothetical protein  32.03 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3308  putative cytoplasmic protein  32.03 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.74 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50820  DUF796 family protein  33.55 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.743665  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3302  putative cytoplasmic protein  32.03 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.74 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3408  hypothetical protein  33.12 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  32.74 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  33.54 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  33.1 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  32.48 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  35.21 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  32.39 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  31.85 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  31.21 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>