More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6634 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  68.59 
 
 		 307 aa  248  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  68.59 
 
 		 307 aa  248  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  69.63 
 
 		 309 aa  247  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  62.3 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  60.21 
 
 		 196 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  58.12 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  55.68 
 
 		 201 aa  208  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  51.31 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  52.46 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  54.49 
 
 		 191 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  54.49 
 
 		 191 aa  176  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  53.3 
 
 		 209 aa  174  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  51.6 
 
 		 198 aa  174  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  50.82 
 
 		 182 aa  172  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  51.89 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  49.73 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  48.66 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  52.75 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  44.68 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  45.79 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  46.2 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  51.35 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  48.63 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  47.51 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  47.92 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  47.54 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  47.54 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  48.31 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  59.15 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  45.9 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  45.9 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  54.59 
 
 		 190 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  44.81 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  45.96 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  53.51 
 
 		 189 aa  155  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  43.24 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  46.99 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  52.25 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.9 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 199 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  48.37 
 
 		 194 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  48.97 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  48.97 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  45.9 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  45.9 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  46.52 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  51.35 
 
 		 196 aa  148  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  51.32 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 		 188 aa  147  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  42.47 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  50.81 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  48.11 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  44.39 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  43.85 
 
 		 184 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  44.57 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  45.56 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  42.21 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  44.39 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  46.99 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  51.02 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 		 183 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  41.08 
 
 		 188 aa  140  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  48.6 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  40.84 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  46.39 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  41.44 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  43.89 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  44.94 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  43.01 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  41.44 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  41.44 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  44.44 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  43.85 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  44.85 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  44.85 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  44.85 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  43.85 
 
 		 194 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  45.92 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  44.39 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  44.39 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  44.39 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 		 293 aa  131  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  46.15 
 
 		 228 aa  131  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  47.83 
 
 		 326 aa  131  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  44 
 
 		 203 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  47.1 
 
 		 298 aa  131  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 185 aa  130  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  44.68 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>