More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6627 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1254    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 607 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.15 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  45.32 
 
 		 546 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  44.05 
 
 		 545 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  44.26 
 
 		 545 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0955  TPR domain-containing protein  41.43 
 
 		 705 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.497218  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 545 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  45.37 
 
 		 496 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 571 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  42.74 
 
 		 588 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 		 536 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  45.37 
 
 		 600 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  44.42 
 
 		 593 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  45.15 
 
 		 573 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0462  TPR domain-containing protein  43.25 
 
 		 711 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1949  TPR repeat-containing protein  43.07 
 
 		 598 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.411479  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2044  TPR domain-containing protein  43.07 
 
 		 598 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 		 559 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 		 1450 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 688 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5711  Tetratricopeptide TPR_2 domain-containing protein  37.81 
 
 		 488 aa  248  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 602 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1038 aa  243  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 601 aa  241  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  34.14 
 
 		 703 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 		 578 aa  230  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1568  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 487 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 1827 aa  228  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 608 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  30.45 
 
 		 648 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 767 aa  227  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 523 aa  223  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 542 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 3145 aa  221  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  32.88 
 
 		 1764 aa  219  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 556 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.21 
 
 		 872 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.39 
 
 		 1677 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 740 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  32.93 
 
 		 550 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  34.83 
 
 		 577 aa  211  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  34.16 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.05 
 
 		 689 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.39 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  30.45 
 
 		 615 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 484 aa  208  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 1005 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 747 aa  205  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.13 
 
 		 1034 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 747 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 472 aa  204  5e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2766  Tetratricopeptide TPR_4  36.39 
 
 		 492 aa  203  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392213  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  32.26 
 
 		 473 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 646 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 955 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1451 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.69 
 
 		 714 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1454 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  36.55 
 
 		 389 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 481 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 592 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.22 
 
 		 604 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  34.47 
 
 		 607 aa  193  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 583 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 		 714 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1218  hypothetical protein  33.76 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 681 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 529 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 649 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 649 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 527 aa  190  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 		 520 aa  190  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 		 780 aa  190  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 566 aa  189  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  26.06 
 
 		 653 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 653 aa  189  9e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 595 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  35.88 
 
 		 451 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 637 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 457 aa  187  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.96 
 
 		 760 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 438 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  35.81 
 
 		 1212 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  33.75 
 
 		 387 aa  183  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  32.56 
 
 		 630 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 662 aa  182  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.4 
 
 		 626 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  33.14 
 
 		 360 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 620 aa  180  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 558 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  31.34 
 
 		 525 aa  179  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 935 aa  178  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  28.24 
 
 		 603 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 639 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.95 
 
 		 620 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 614 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>