More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6453 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  82.88 
 
 		 475 aa  829    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  97.89 
 
 		 474 aa  942    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  70.13 
 
 		 473 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  96.41 
 
 		 474 aa  931    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  70.68 
 
 		 472 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  70.68 
 
 		 472 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  95.14 
 
 		 474 aa  916    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 472 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 472 aa  685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  73.46 
 
 		 475 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 479 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  70.46 
 
 		 493 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  69.7 
 
 		 473 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  96.84 
 
 		 474 aa  934    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  95.14 
 
 		 474 aa  916    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  100 
 
 		 475 aa  980    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  69.77 
 
 		 473 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  95.56 
 
 		 474 aa  924    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 532 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  95.75 
 
 		 474 aa  919    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  66.53 
 
 		 477 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  82.03 
 
 		 474 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  70.61 
 
 		 478 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  69.21 
 
 		 475 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  94.93 
 
 		 474 aa  915    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  97.68 
 
 		 474 aa  939    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 472 aa  685    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  69.49 
 
 		 478 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  70.89 
 
 		 472 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  70.4 
 
 		 473 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  95.35 
 
 		 474 aa  922    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 475 aa  975    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 473 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  97.68 
 
 		 474 aa  939    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  94.93 
 
 		 474 aa  915    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  67.02 
 
 		 477 aa  667    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  52.64 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 487 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  47.68 
 
 		 469 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  48.2 
 
 		 500 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  47.26 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 469 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 469 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 477 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.78 
 
 		 484 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.78 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.58 
 
 		 492 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 489 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.51 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 473 aa  425  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 469 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  45.84 
 
 		 481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  44.47 
 
 		 477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  44.47 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  43.22 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.71 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.83 
 
 		 483 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  43.74 
 
 		 477 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  43.95 
 
 		 477 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.07 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 481 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.01 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 483 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.98 
 
 		 472 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 479 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 483 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.31 
 
 		 470 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.81 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  43.95 
 
 		 479 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  44.89 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  41.88 
 
 		 470 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  42.68 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  39.36 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.81 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  41.24 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2044  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  40.81 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00402201  hitchhiker  0.0000000000000583102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  41.24 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>