More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6397 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
333 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  97.9 
 
 
333 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  90.99 
 
 
333 aa  590  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  90.09 
 
 
333 aa  583  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  90.09 
 
 
333 aa  583  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  88.29 
 
 
333 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  77.22 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  77.22 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  77.22 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  77.22 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  77.22 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  77.22 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  76.9 
 
 
333 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  59.1 
 
 
328 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  55.35 
 
 
344 aa  328  7e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  55.35 
 
 
344 aa  328  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  56.66 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  47.52 
 
 
323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  47.26 
 
 
328 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  42.86 
 
 
325 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  37.31 
 
 
321 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  33.23 
 
 
499 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  39.75 
 
 
501 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0456  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  38.65 
 
 
499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  39.76 
 
 
498 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 
344 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  28.47 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.15 
 
 
337 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
310 aa  92.8  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
322 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  30.22 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
301 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  32.37 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
305 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
528 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.55 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  35.03 
 
 
314 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
333 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  31.4 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
322 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 
298 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  36.32 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
1250 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
345 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
703 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  35.06 
 
 
561 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  33.33 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  30.73 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
477 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
924 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.94 
 
 
2401 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  27.82 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
1077 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27 
 
 
1340 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  25.76 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  34.45 
 
 
838 aa  73.2  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 
346 aa  72.8  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
754 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  31.5 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
884 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
328 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  27.37 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>