More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6388 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  90.41 
 
 
439 aa  788  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  90.41 
 
 
439 aa  788  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
438 aa  872  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  90.21 
 
 
439 aa  788  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  90.41 
 
 
438 aa  794  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  99.32 
 
 
438 aa  868  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.85 
 
 
498 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.62 
 
 
495 aa  612  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.62 
 
 
499 aa  612  1e-174  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.85 
 
 
443 aa  614  1e-174  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.62 
 
 
443 aa  612  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.85 
 
 
443 aa  614  1e-174  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.62 
 
 
443 aa  612  1e-174  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  60.19 
 
 
419 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  60.19 
 
 
430 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  60.49 
 
 
437 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  60.49 
 
 
437 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  52.29 
 
 
440 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  53.54 
 
 
672 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  54.09 
 
 
442 aa  416  1e-115  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  48.57 
 
 
650 aa  408  1e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  48.33 
 
 
422 aa  406  1e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  50.87 
 
 
435 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 
434 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  46.19 
 
 
406 aa  305  9e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  44.99 
 
 
422 aa  305  1e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  45.78 
 
 
415 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  45.23 
 
 
405 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  45.01 
 
 
402 aa  290  5e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  43.92 
 
 
403 aa  289  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  45.17 
 
 
406 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  46.21 
 
 
397 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 
423 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  38.5 
 
 
426 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  39.61 
 
 
421 aa  256  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 
453 aa  253  4e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  41.82 
 
 
420 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  35.31 
 
 
419 aa  249  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  35.19 
 
 
423 aa  249  9e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1295  glycosyl transferase, group 1  41 
 
 
408 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675113  normal  0.124079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1278  glycosyl transferase, group 1  41 
 
 
408 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
426 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  42.56 
 
 
418 aa  247  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  39.04 
 
 
421 aa  246  5e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1307  glycosyl transferase, group 1  40.52 
 
 
408 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
425 aa  240  3e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.63553e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
422 aa  239  7e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 
477 aa  234  2e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
424 aa  232  8e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  40.55 
 
 
407 aa  230  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  37.59 
 
 
429 aa  226  5e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  34.07 
 
 
426 aa  224  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  38.21 
 
 
448 aa  220  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
405 aa  217  3e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  38.02 
 
 
450 aa  217  3e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  36.39 
 
 
434 aa  216  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
393 aa  213  5e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  35.99 
 
 
417 aa  213  8e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  35.05 
 
 
427 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.73 
 
 
405 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  38.08 
 
 
418 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
405 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  35.54 
 
 
458 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  36.83 
 
 
417 aa  208  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  35.93 
 
 
482 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  35.71 
 
 
428 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  35.43 
 
 
431 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.58 
 
 
435 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  34.26 
 
 
448 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  34.31 
 
 
431 aa  201  2e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 
434 aa  198  1e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.77 
 
 
420 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  33.41 
 
 
443 aa  192  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  34.56 
 
 
466 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
439 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 
458 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 
438 aa  189  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
435 aa  189  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 
450 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  32.52 
 
 
424 aa  186  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
435 aa  184  2e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  34.23 
 
 
480 aa  184  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  33.18 
 
 
443 aa  183  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
442 aa  182  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
439 aa  180  5e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  34.57 
 
 
439 aa  180  5e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
421 aa  176  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  33.16 
 
 
420 aa  173  7e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  32.37 
 
 
413 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
448 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4103  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
400 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11840  glycosyltransferase  32.14 
 
 
411 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.363429  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  32.51 
 
 
405 aa  152  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1891  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
415 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  28.42 
 
 
784 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3722  glycosyl transferase, group 1  32.92 
 
 
400 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  29.95 
 
 
392 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.73 
 
 
388 aa  137  3e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
415 aa  135  1e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
413 aa  135  2e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>