80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6250 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6535  ABC transporter substrate binding protein  98.01 
 
 		 351 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6250  ABC transporter substrate binding protein  100 
 
 		 351 aa  708    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6192  ABC transporter substrate binding protein  96.89 
 
 		 343 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1244  ABC transporter substrate binding protein  96.89 
 
 		 343 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6588  ABC transporter substrate binding protein  96.89 
 
 		 343 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6049  ABC transporter substrate binding protein  89.17 
 
 		 351 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0154  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  77.29 
 
 		 350 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3603  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  74.93 
 
 		 350 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2170  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  76.37 
 
 		 350 aa  534  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4137  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  75.81 
 
 		 341 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0818  ABC transporter substrate binding protein  76.53 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2032  ABC transporter substrate binding protein  76.53 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1878  ABC transporter substrate binding protein  76.53 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1866  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  76.53 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.346438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0343  ABC transporter substrate-binding protein  76.53 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.658815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1687  ABC transporter substrate binding protein  76.53 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0512  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.64 
 
 		 366 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2677  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  67.54 
 
 		 343 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5057  ABC transporter, periplasmic binding protein  66.47 
 
 		 339 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0138  NLPA lipoprotein  66.67 
 
 		 341 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34770  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  67.64 
 
 		 340 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.429191  normal  0.0167014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0191  ABC transporter periplasmic-binding protein  65.88 
 
 		 339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0170  ABC transporter, periplasmic binding protein  66.17 
 
 		 339 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30920  ABC transporter, periplasmic binding protein  65.37 
 
 		 343 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0189  ABC transporter, periplasmic binding protein  66.77 
 
 		 339 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.366153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2486  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  65.51 
 
 		 345 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00383664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3450  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  66.28 
 
 		 343 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302208  hitchhiker  0.000774086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4888  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  55.45 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.962716  normal  0.144986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2205  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.67 
 
 		 337 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0340  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.78 
 
 		 339 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5195  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.04 
 
 		 339 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1797  ABC transporter periplasmic binding protein  51.75 
 
 		 340 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1399  ABC transporter periplasmic binding protein  51.46 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1299  ABC transporter periplasmic binding protein  54.95 
 
 		 362 aa  345  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3455  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  49.7 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30880  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.61 
 
 		 339 aa  344  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1388  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.4 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5990  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.6 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.626097 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1728  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  46.08 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4505  NLPA lipoprotein  43.45 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.826664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3889  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.39 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  0.125658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1120  ABC transporter, periplasmic binding protein  41.64 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3152  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.74 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4009  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  46.25 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4122  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  46.25 
 
 		 342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03032  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  45.51 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.08661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1606  NLPA lipoprotein  42.67 
 
 		 346 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000297803 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5982  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.69 
 
 		 334 aa  239  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  0.473207 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3151  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.06 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3888  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.06 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5060  ABC transporter substrate-binding protein  38.53 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6690  putative periplasmic substrate-binding subunit (ABC transporter)  38.54 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0536  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  39.41 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00532956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6244  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  38.1 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  34.77 
 
 		 338 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0054  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  35.1 
 
 		 338 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2525  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.47 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74884  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3590  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3930  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.67 
 
 		 341 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3259  putative periplasmic substrate-binding transmembrane protein  37.99 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3496  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0231638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5326  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5095  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.73 
 
 		 119 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.296668  normal  0.288347 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.46 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0365  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.64 
 
 		 341 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.796573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.9 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0211  sulfate ester transport system substrate-binding protein  28.09 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4186  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.78 
 
 		 480 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4266  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.36 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4370  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.98 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5004  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.63 
 
 		 347 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.72 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1182  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  31.97 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.794723  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4846  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.98 
 
 		 341 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0232  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0409  putative substrate-binding protein of aliphatic sulfonate ABC transporter  19.64 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.830213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  24.82 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  23.7 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  35.92 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>