More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6243 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
316 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  98.42 
 
 
316 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  83.86 
 
 
316 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  83.86 
 
 
316 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  84.49 
 
 
316 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  76.27 
 
 
341 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  79.05 
 
 
323 aa  475  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  79.68 
 
 
316 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  75.08 
 
 
315 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  74.76 
 
 
315 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  67.1 
 
 
335 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  61.94 
 
 
312 aa  348  9e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  36.22 
 
 
329 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  36.72 
 
 
299 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  37.7 
 
 
309 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  35.97 
 
 
301 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  36.63 
 
 
300 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  37.38 
 
 
298 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  37.62 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  36.86 
 
 
295 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  34.75 
 
 
306 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  36.96 
 
 
313 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  40.58 
 
 
310 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  35.08 
 
 
325 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  36.89 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  33.66 
 
 
301 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  36.01 
 
 
305 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  36.22 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  35.2 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  35.41 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  34.21 
 
 
315 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  39.41 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  34.95 
 
 
307 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  34.67 
 
 
314 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  33.55 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  36.31 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  35.28 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  31.19 
 
 
311 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  36.51 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  36.48 
 
 
314 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  38.31 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  37.99 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2858  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 
322 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  30.34 
 
 
309 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  38.64 
 
 
310 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  31.44 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1422  2-dehydropantoate 2-reductase  29.07 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.66 
 
 
318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  30.53 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  32.02 
 
 
355 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
314 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  36.99 
 
 
296 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
314 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 
318 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  27.22 
 
 
316 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2991  2-dehydropantoate 2-reductase  33.57 
 
 
337 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.1296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  36.94 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  32.57 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  34.08 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  31.44 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.82 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  31.23 
 
 
315 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  30.94 
 
 
351 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  29.74 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  29.01 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  33.13 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  29.13 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  33.9 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  29.17 
 
 
337 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  28.8 
 
 
305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  32.47 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  30.89 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  32.08 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3165  2-dehydropantoate 2-reductase  27.36 
 
 
305 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1790  2-dehydropantoate 2-reductase  32.55 
 
 
332 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  26.11 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 
307 aa  113  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1719  2-dehydropantoate 2-reductase  33.33 
 
 
312 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  28.92 
 
 
324 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  27.13 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  30.96 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4671  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 
325 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
336 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  29.55 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1850  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
353 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.9641 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  35.06 
 
 
294 aa  109  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 
324 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  27.99 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>