More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6233 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  59.32 
 
 		 763 aa  834    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  59.64 
 
 		 763 aa  807    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  54.12 
 
 		 776 aa  677    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  76.39 
 
 		 763 aa  1085    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 737 aa  1442    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  65.1 
 
 		 763 aa  904    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  53.98 
 
 		 802 aa  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  59.32 
 
 		 763 aa  834    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  46.92 
 
 		 759 aa  595  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 		 760 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  44.19 
 
 		 764 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  50.69 
 
 		 618 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  43.38 
 
 		 765 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  45.89 
 
 		 780 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  47.15 
 
 		 775 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  45.05 
 
 		 764 aa  522  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  46.01 
 
 		 775 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  49.58 
 
 		 616 aa  487  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  46.6 
 
 		 791 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 		 762 aa  485  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  48.8 
 
 		 599 aa  479  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  49.22 
 
 		 626 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  45.55 
 
 		 621 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  49.19 
 
 		 626 aa  438  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  47.38 
 
 		 611 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  48.8 
 
 		 629 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  48.62 
 
 		 646 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  43.29 
 
 		 661 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  43.69 
 
 		 794 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0394  heavy metal translocating P-type ATPase  50.27 
 
 		 641 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  44.97 
 
 		 644 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 641 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  39.04 
 
 		 602 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2566  heavy metal translocating P-type ATPase  48.8 
 
 		 642 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  42.93 
 
 		 627 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  42.61 
 
 		 658 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3593  heavy metal translocating P-type ATPase  47.59 
 
 		 637 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  35.67 
 
 		 593 aa  336  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  35.26 
 
 		 630 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  35.74 
 
 		 654 aa  320  7e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  34.22 
 
 		 719 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  31.55 
 
 		 630 aa  300  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  36.61 
 
 		 801 aa  297  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09580  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  37.96 
 
 		 639 aa  291  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.477007  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3504  heavy metal translocating P-type ATPase  38.94 
 
 		 743 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  36.79 
 
 		 818 aa  289  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3091  copper-translocating P-type ATPase  39.27 
 
 		 868 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344658  normal  0.403922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 787 aa  287  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0966887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  32.62 
 
 		 751 aa  286  8e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5743  heavy metal translocating P-type ATPase  38.06 
 
 		 655 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  37.41 
 
 		 656 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2654  heavy metal translocating P-type ATPase  37.11 
 
 		 654 aa  284  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18472  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2339  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 643 aa  285  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2866  heavy metal translocating P-type ATPase  37.19 
 
 		 655 aa  284  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0056  copper-transporting P-type ATPase  37.25 
 
 		 804 aa  283  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  38.66 
 
 		 833 aa  283  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1856  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 		 973 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.121057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 		 750 aa  283  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  36.32 
 
 		 737 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3818  heavy metal translocating P-type ATPase  36.43 
 
 		 895 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 		 743 aa  280  5e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4430  heavy metal translocating P-type ATPase  36.28 
 
 		 651 aa  280  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  34.35 
 
 		 738 aa  280  7e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 641 aa  279  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0397  heavy metal translocating P-type ATPase  33.1 
 
 		 641 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  37.25 
 
 		 724 aa  278  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  32.39 
 
 		 641 aa  278  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3871  heavy metal translocating P-type ATPase  37.98 
 
 		 908 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19630  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  37.44 
 
 		 656 aa  277  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00267622  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0721  cadmium-translocating P-type ATPase  36.86 
 
 		 646 aa  277  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000381193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3242  heavy metal translocating P-type ATPase  37.94 
 
 		 655 aa  277  6e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  30.8 
 
 		 783 aa  277  7e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0093  heavy metal translocating P-type ATPase  33.5 
 
 		 619 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  38.66 
 
 		 783 aa  276  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5371  heavy metal translocating P-type ATPase  37.37 
 
 		 652 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  32.06 
 
 		 894 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5294  heavy metal translocating P-type ATPase  37.26 
 
 		 652 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2429  copper-translocating P-type ATPase  37.07 
 
 		 773 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  31.87 
 
 		 641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0177  heavy metal translocating P-type ATPase  36.33 
 
 		 755 aa  275  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.963495  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  31.87 
 
 		 641 aa  275  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25770  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  38.32 
 
 		 656 aa  275  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  32.57 
 
 		 641 aa  274  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  33.68 
 
 		 707 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20140  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  34.32 
 
 		 628 aa  273  7e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0159818  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 		 734 aa  273  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1480  heavy metal translocating P-type ATPase  36.79 
 
 		 811 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  32.98 
 
 		 679 aa  272  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24490  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  34.04 
 
 		 667 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0776  heavy metal translocating P-type ATPase  34.8 
 
 		 630 aa  272  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.634796  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  32.47 
 
 		 641 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0606  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 		 655 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.72822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  32.47 
 
 		 641 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  32.47 
 
 		 641 aa  272  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3097  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 		 670 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0656722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3179  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 		 655 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0324717  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  31.87 
 
 		 641 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>