More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6213 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  100 
 
 
311 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  93.25 
 
 
326 aa  577  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  58.52 
 
 
350 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  54.55 
 
 
310 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  54.55 
 
 
310 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  55.7 
 
 
312 aa  322  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  51.94 
 
 
312 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  53.57 
 
 
320 aa  295  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  58.96 
 
 
319 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0142  6-phosphofructokinase  58.96 
 
 
449 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  58.96 
 
 
442 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1061  6-phosphofructokinase  58.63 
 
 
473 aa  291  7e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2801  6-phosphofructokinase  58.96 
 
 
442 aa  291  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0117  6-phosphofructokinase  58.63 
 
 
313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.425827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  48.71 
 
 
312 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  48.23 
 
 
312 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  46.25 
 
 
311 aa  275  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  49.19 
 
 
312 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  45.28 
 
 
311 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1098  1-phosphofructokinase  52.1 
 
 
334 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424863  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  46.62 
 
 
312 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  44.33 
 
 
319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  44.67 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6479  6-phosphofructokinase  50.81 
 
 
312 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  43.33 
 
 
322 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  39.16 
 
 
311 aa  241  7.999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  41.2 
 
 
324 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  41.2 
 
 
324 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  41.2 
 
 
324 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  42.19 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  42.35 
 
 
339 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  39.47 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  40.19 
 
 
310 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  40.19 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  40.19 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  40.19 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01692  6-phosphofructokinase II  40.13 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1919  1-phosphofructokinase  40.13 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01680  hypothetical protein  40.13 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.943682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2441  6-phosphofructokinase 2  39.81 
 
 
309 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.386774  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1943  6-phosphofructokinase 2  39.81 
 
 
309 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0791846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1468  6-phosphofructokinase 2  40.13 
 
 
309 aa  211  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.193621  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1968  6-phosphofructokinase 2  39.81 
 
 
309 aa  211  9e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  39.55 
 
 
310 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1909  6-phosphofructokinase 2  39.48 
 
 
309 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1804  6-phosphofructokinase 2  39.48 
 
 
309 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0265259  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 
315 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1721  6-phosphofructokinase 2  40.13 
 
 
310 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.132739  normal  0.591583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0882  ribokinase-like domain-containing protein  40.72 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00379836  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2334  6-phosphofructokinase  40.76 
 
 
314 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1009  ribokinase-like domain-containing protein  40.76 
 
 
314 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1621  putative 6-phosphofructokinase isozyme 2  40.51 
 
 
316 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.106511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1592  ribokinase-like domain-containing protein  41.5 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  36.09 
 
 
312 aa  164  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  30.07 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
309 aa  159  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.43 
 
 
310 aa  159  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 
310 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  29.45 
 
 
311 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  32.09 
 
 
310 aa  155  9e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 
316 aa  155  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.57 
 
 
324 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  32.33 
 
 
306 aa  150  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  38.02 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.8 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  33.45 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  36.69 
 
 
325 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
303 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.46 
 
 
303 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.67 
 
 
315 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33.44 
 
 
319 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 
319 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  37.12 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  29.64 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 
324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  27.24 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.25 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  28.95 
 
 
323 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  27.39 
 
 
307 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  38.2 
 
 
318 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  27.96 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33.09 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  29.83 
 
 
306 aa  134  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  34.82 
 
 
318 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  29.64 
 
 
317 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  29.03 
 
 
313 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  31.15 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  28.33 
 
 
305 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  28.53 
 
 
308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  29.22 
 
 
325 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.92 
 
 
315 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>