More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6206 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  64.04 
 
 		 911 aa  1161    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  64.04 
 
 		 911 aa  1161    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  58.35 
 
 		 994 aa  1065    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  64.54 
 
 		 916 aa  1152    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  64.81 
 
 		 930 aa  1164    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  51.41 
 
 		 906 aa  885    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  55.75 
 
 		 907 aa  971    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.01 
 
 		 914 aa  909    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  61.14 
 
 		 922 aa  1120    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  54.74 
 
 		 932 aa  988    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  62.42 
 
 		 933 aa  1150    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  76.45 
 
 		 1071 aa  786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  58.95 
 
 		 920 aa  1075    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  76.45 
 
 		 1071 aa  786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  51.96 
 
 		 906 aa  894    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  55.74 
 
 		 912 aa  946    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  68.63 
 
 		 922 aa  1237    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  80.99 
 
 		 1082 aa  785    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  51.6 
 
 		 906 aa  881    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  54.7 
 
 		 901 aa  902    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.7 
 
 		 913 aa  906    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  63.23 
 
 		 913 aa  1157    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  56.19 
 
 		 912 aa  977    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  57.2 
 
 		 943 aa  1020    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  63.93 
 
 		 921 aa  1151    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  64.14 
 
 		 911 aa  1161    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  55.88 
 
 		 915 aa  987    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  100 
 
 		 936 aa  1870    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  54.97 
 
 		 917 aa  995    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  64.04 
 
 		 911 aa  1161    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  69.76 
 
 		 936 aa  1256    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  79.25 
 
 		 1017 aa  811    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  64.66 
 
 		 914 aa  1170    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  54.76 
 
 		 901 aa  903    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  63.23 
 
 		 913 aa  1157    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  61.93 
 
 		 925 aa  1124    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  64.14 
 
 		 911 aa  1162    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  63.34 
 
 		 913 aa  1157    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  76.45 
 
 		 1079 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  62.27 
 
 		 924 aa  1108    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  59.93 
 
 		 926 aa  1102    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  69.77 
 
 		 930 aa  1254    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  64.35 
 
 		 929 aa  1144    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  51.52 
 
 		 906 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  62.25 
 
 		 930 aa  1081    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  62.83 
 
 		 927 aa  1104    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  69.74 
 
 		 921 aa  1249    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  52.55 
 
 		 928 aa  913    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  55.52 
 
 		 912 aa  964    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  56.53 
 
 		 904 aa  978    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  72.72 
 
 		 927 aa  1293    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  54.61 
 
 		 901 aa  907    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  56 
 
 		 916 aa  965    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  62.14 
 
 		 908 aa  1069    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  64.04 
 
 		 911 aa  1160    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  70.38 
 
 		 919 aa  1278    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  64.04 
 
 		 911 aa  1160    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  57.25 
 
 		 911 aa  960    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  80.39 
 
 		 1089 aa  785    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  69.76 
 
 		 936 aa  1259    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  52.54 
 
 		 935 aa  966    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  55.68 
 
 		 912 aa  972    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  51.18 
 
 		 942 aa  866    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  63.34 
 
 		 913 aa  1158    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  52.02 
 
 		 918 aa  949    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  64.14 
 
 		 911 aa  1162    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  63.05 
 
 		 911 aa  1116    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  64.51 
 
 		 916 aa  1134    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  63.71 
 
 		 911 aa  1154    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  91.72 
 
 		 942 aa  1617    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  69.56 
 
 		 927 aa  1268    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  62.08 
 
 		 912 aa  1076    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  76.87 
 
 		 1066 aa  787    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  70 
 
 		 918 aa  1222    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  64.07 
 
 		 901 aa  1139    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  57.69 
 
 		 909 aa  990    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  38.43 
 
 		 651 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  43.22 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  41.54 
 
 		 510 aa  357  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40.04 
 
 		 593 aa  345  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  37.8 
 
 		 590 aa  340  8e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 		 576 aa  327  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 541 aa  327  7e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  37.37 
 
 		 587 aa  326  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  38.14 
 
 		 583 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  38.42 
 
 		 575 aa  318  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 		 578 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 578 aa  316  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  33.96 
 
 		 1106 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 		 578 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 		 578 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  36.66 
 
 		 590 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  36.06 
 
 		 578 aa  316  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  35.43 
 
 		 579 aa  314  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  36.2 
 
 		 588 aa  309  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  37.46 
 
 		 579 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  37.98 
 
 		 582 aa  305  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  31.64 
 
 		 691 aa  274  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 		 580 aa  228  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  43.54 
 
 		 580 aa  228  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>