257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6150 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6150  OsmC family protein  100 
 
 		 408 aa  820    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6443  OsmC family protein  98.77 
 
 		 408 aa  810    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.588479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  53.98 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  57.79 
 
 		 418 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  52.96 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  51.97 
 
 		 409 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0049  OsmC family protein  52.51 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  51.6 
 
 		 406 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  48.65 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  51.09 
 
 		 406 aa  363  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  51.36 
 
 		 410 aa  362  4e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  50.62 
 
 		 406 aa  363  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  49.75 
 
 		 415 aa  359  6e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  51.9 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  51.6 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  49.14 
 
 		 412 aa  346  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  51 
 
 		 405 aa  346  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  50 
 
 		 409 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  43.21 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  50.5 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  46.94 
 
 		 402 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  48.36 
 
 		 410 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  45.3 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  47.61 
 
 		 410 aa  323  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  51.88 
 
 		 251 aa  255  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  42.21 
 
 		 411 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0227  hypothetical protein  53.5 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  53.28 
 
 		 257 aa  242  9e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3055  OsmC-like family protein  51.98 
 
 		 255 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0403  OsmC family protein  54.12 
 
 		 259 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1127  putative redox protein  46.22 
 
 		 256 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2450  hypothetical protein  48.63 
 
 		 258 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1911  hydrolase of the alpha/beta superfamily protein  47.51 
 
 		 259 aa  217  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0630248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1200  putative redox protein  46.03 
 
 		 256 aa  211  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3247  putative redox protein  48.02 
 
 		 250 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  40.96 
 
 		 259 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2961  OsmC-like family protein  47.43 
 
 		 250 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  46.28 
 
 		 256 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1067  hypothetical protein  53.47 
 
 		 145 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0889291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  50.43 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0732  OsmC family protein  45.24 
 
 		 137 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  42.11 
 
 		 153 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  48.15 
 
 		 132 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  42.86 
 
 		 133 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  42.5 
 
 		 133 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  42.37 
 
 		 133 aa  93.6  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  47.22 
 
 		 132 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  42.02 
 
 		 153 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  42.02 
 
 		 133 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  42.02 
 
 		 133 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  39.5 
 
 		 133 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  39.5 
 
 		 133 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  39.5 
 
 		 133 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  42.02 
 
 		 133 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  42.02 
 
 		 133 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  42.02 
 
 		 133 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  40.98 
 
 		 132 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  43.22 
 
 		 137 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  38.66 
 
 		 133 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1440  OsmC family protein  37.82 
 
 		 142 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  37.29 
 
 		 130 aa  86.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  38.74 
 
 		 130 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  37.29 
 
 		 130 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  35.59 
 
 		 130 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  37.29 
 
 		 130 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  37.84 
 
 		 130 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.51 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  36.43 
 
 		 135 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1619  hypothetical protein  40.34 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0276  hypothetical protein  40.34 
 
 		 129 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  36.07 
 
 		 128 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  37.21 
 
 		 135 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  36.94 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  36.45 
 
 		 131 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  34.43 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  32.1 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  38.39 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  39.25 
 
 		 141 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  38.71 
 
 		 127 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1856  OsmC family protein  37.01 
 
 		 129 aa  77.4  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2484  OsmC family protein  29.92 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.092178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  42.2 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  33.88 
 
 		 129 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  31.71 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1483  hypothetical protein  28.4 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2193  OsmC family protein  35.85 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.208378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  31.03 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1919  OsmC family protein  36.75 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2898  OsmC-like protein  34.95 
 
 		 135 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1832  OsmC-like protein  37.38 
 
 		 133 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03205  Alpha/beta superfamily hydrolase  26.52 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  25.34 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  32.65 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  28.29 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3965  OsmC family protein  29.46 
 
 		 132 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0702  hypothetical protein  28.02 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00518069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0246  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.58 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5556  OsmC-like protein  28.95 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000078778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>