More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6111 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  100 
 
 
393 aa  820    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  72.63 
 
 
392 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  51.41 
 
 
412 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  40.51 
 
 
391 aa  331  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  40.56 
 
 
386 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  40.77 
 
 
391 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  39.44 
 
 
393 aa  317  3e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  39.44 
 
 
393 aa  316  5e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  39.44 
 
 
393 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  41.18 
 
 
394 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  40.15 
 
 
386 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1840  putative aminotransferase protein  54.18 
 
 
292 aa  299  7e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.118239 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 
390 aa  297  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  35.29 
 
 
383 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  38.68 
 
 
401 aa  296  5e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  34.53 
 
 
383 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  34.27 
 
 
383 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  34.78 
 
 
383 aa  289  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  34.78 
 
 
383 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  34.53 
 
 
383 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  35.2 
 
 
383 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  35.95 
 
 
397 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  37.94 
 
 
397 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  36.92 
 
 
389 aa  287  2e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  34.02 
 
 
383 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  38.3 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  35.9 
 
 
390 aa  285  7e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  38.6 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  33.76 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  33.76 
 
 
383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  33.67 
 
 
383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  35.11 
 
 
393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  38.3 
 
 
385 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  36.2 
 
 
393 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  38.72 
 
 
386 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  37.82 
 
 
392 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  38.83 
 
 
390 aa  275  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  38.58 
 
 
390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  38.21 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  38.36 
 
 
390 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  33.84 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 
521 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  37.6 
 
 
390 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  37.69 
 
 
383 aa  268  8.999999999999999e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  35.71 
 
 
400 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  36.73 
 
 
396 aa  268  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  37.22 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  36.62 
 
 
396 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  35.9 
 
 
386 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  39.29 
 
 
386 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  37.72 
 
 
390 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  37.02 
 
 
391 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 
383 aa  264  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  35.11 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  36.92 
 
 
390 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  37.15 
 
 
393 aa  262  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  37.56 
 
 
384 aa  259  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  36.04 
 
 
395 aa  258  9e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  36.2 
 
 
409 aa  257  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  35.46 
 
 
392 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  35.46 
 
 
392 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  37.95 
 
 
376 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  37.22 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  36.64 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  37.24 
 
 
375 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  34.88 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  36.5 
 
 
385 aa  252  8.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  35.22 
 
 
389 aa  250  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  32.74 
 
 
387 aa  249  6e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
387 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  34.18 
 
 
394 aa  246  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 
393 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  32.32 
 
 
387 aa  247  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  35.23 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  34.11 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  31.88 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  34.01 
 
 
394 aa  243  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  32.74 
 
 
389 aa  242  7e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  35.71 
 
 
381 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  36.8 
 
 
385 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  36.8 
 
 
385 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  34.53 
 
 
390 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
390 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  34.77 
 
 
390 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  34.01 
 
 
390 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  34.01 
 
 
390 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  34.01 
 
 
390 aa  230  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  34.01 
 
 
390 aa  229  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  33.76 
 
 
390 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  33.76 
 
 
390 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  33.76 
 
 
390 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  33.76 
 
 
390 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  33.5 
 
 
390 aa  227  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  34.28 
 
 
383 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  31.22 
 
 
386 aa  222  9e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  35.2 
 
 
395 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 
400 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  28.53 
 
 
396 aa  218  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>