283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6087 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
151 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
151 aa  310  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  92 
 
 
151 aa  290  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  92 
 
 
151 aa  287  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  90.67 
 
 
151 aa  281  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  85.23 
 
 
149 aa  270  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  64.19 
 
 
151 aa  204  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.49 
 
 
151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.41 
 
 
145 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.72 
 
 
145 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0025  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.78 
 
 
153 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0126747 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  51.72 
 
 
149 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.41 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.03 
 
 
145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.03 
 
 
145 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  49.66 
 
 
145 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  51.72 
 
 
149 aa  147  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.72 
 
 
145 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.03 
 
 
145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.9 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.62 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.35 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.89 
 
 
163 aa  144  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
153 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
143 aa  144  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.55 
 
 
157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.18 
 
 
163 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.18 
 
 
163 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  47.26 
 
 
162 aa  141  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2902  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.71 
 
 
148 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.97 
 
 
145 aa  140  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  43.71 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.07 
 
 
155 aa  138  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  43.84 
 
 
145 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  46.9 
 
 
145 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  43.15 
 
 
145 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.47 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
145 aa  133  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.18 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.47 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.92 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.2 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.48 
 
 
155 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.45 
 
 
152 aa  130  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.77 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4015  carboxymuconolactone decarboxylase  49.3 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0483947 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  41.78 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.66 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  45 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 
150 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.26 
 
 
153 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.62 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.62 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.62 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.62 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.62 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.95 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.56 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.95 
 
 
283 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.29 
 
 
143 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  46.76 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  46.76 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
159 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
154 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
167 aa  123  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  43.36 
 
 
158 aa  123  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
155 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.74 
 
 
153 aa  120  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
159 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  46.04 
 
 
144 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  46.04 
 
 
144 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  40 
 
 
159 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  46.04 
 
 
144 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
159 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
160 aa  120  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  50.44 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  39.29 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  43.24 
 
 
149 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  38.62 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
159 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
147 aa  117  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.31 
 
 
159 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
159 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.15 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  42.57 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
147 aa  114  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>