More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5863 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  544  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  97.41 
 
 		 270 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  92.57 
 
 		 270 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  88.1 
 
 		 270 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  91.45 
 
 		 270 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  91.45 
 
 		 270 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  70.45 
 
 		 272 aa  390  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  68.7 
 
 		 281 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  68.68 
 
 		 267 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  66.04 
 
 		 276 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  68.99 
 
 		 270 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  70.08 
 
 		 271 aa  364  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  69.5 
 
 		 269 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  69.5 
 
 		 269 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  44.26 
 
 		 286 aa  236  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  51.49 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  52.8 
 
 		 279 aa  228  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  41 
 
 		 283 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 283 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  33.62 
 
 		 425 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  34.43 
 
 		 233 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  33.76 
 
 		 234 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  33.96 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 282 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.48 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 255 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.67 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  30.71 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.82 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  30.71 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  31.09 
 
 		 296 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  30.71 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0882  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.16136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  30.23 
 
 		 219 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  30.53 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1236  alpha/beta fold family hydrolase  33.19 
 
 		 239 aa  99.4  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000165889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.4 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 283 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.37 
 
 		 272 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  31.92 
 
 		 327 aa  92.8  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 284 aa  92.8  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 		 259 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.73 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.87 
 
 		 263 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.72 
 
 		 374 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  30.53 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  28.1 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 277 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  28.2 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 267 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.56 
 
 		 261 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.56 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.08 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.77 
 
 		 392 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 277 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 		 239 aa  85.5  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.84 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  32.91 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.72 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  31.1 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  28.11 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>