More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5753 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6526  adenylosuccinate synthetase  94.17 
 
 		 432 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.768523 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6675  adenylosuccinate synthase  92.54 
 
 		 432 aa  755    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5832  adenylosuccinate synthase  92.31 
 
 		 432 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5753  adenylosuccinate synthase  100 
 
 		 429 aa  855    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.590489 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5326  adenylosuccinate synthase  90.68 
 
 		 432 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0668634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5997  adenylosuccinate synthase  98.37 
 
 		 429 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.140056  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6199  adenylosuccinate synthase  92.31 
 
 		 453 aa  753    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0247215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1007  Adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0196756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0262  adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 		 431 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0037  adenylosuccinate synthetase  58.88 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.505248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0558  adenylosuccinate synthetase  57.61 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0875  adenylosuccinate synthetase  57.81 
 
 		 430 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5638  adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 		 430 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171619  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2965  adenylosuccinate synthetase  57.58 
 
 		 430 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.125391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6845  adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0962  Adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.470264  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4086  adenylosuccinate synthetase  57.11 
 
 		 430 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0852587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3089  adenylosuccinate synthetase  58.24 
 
 		 432 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126084  normal  0.070043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0999  adenylosuccinate synthase  59.21 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.595096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2144  adenylosuccinate synthase  57.81 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2010  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0366  adenylosuccinate synthetase  56.88 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7581  adenylosuccinate synthetase  58.97 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1330  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal  0.220841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3894  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1123  adenylosuccinate synthetase  56.64 
 
 		 457 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0940  Adenylosuccinate synthase  58.97 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3346  adenylosuccinate synthetase  57.77 
 
 		 432 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  hitchhiker  0.00582802 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1231  adenylosuccinate synthetase  56.78 
 
 		 429 aa  494  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1683  adenylosuccinate synthetase  56.78 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469628  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1627  adenylosuccinate synthetase  56.54 
 
 		 533 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1850  adenylosuccinate synthetase  56.18 
 
 		 430 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4774  adenylosuccinate synthetase  56.41 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3544  adenylosuccinate synthetase  57.08 
 
 		 432 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0475  adenylosuccinate synthetase  59.67 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.636476  hitchhiker  0.00197029 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0603  adenylosuccinate synthetase  56.07 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2784  adenylosuccinate synthetase  58.55 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1106  adenylosuccinate synthetase  56.44 
 
 		 429 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2616  adenylosuccinate synthetase  56.84 
 
 		 432 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3159  adenylosuccinate synthetase  56.38 
 
 		 432 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1969  adenylosuccinate synthetase  54.48 
 
 		 437 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.769944  normal  0.0974254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4682  adenylosuccinate synthetase  55.97 
 
 		 429 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0658  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 		 428 aa  475  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.163412  normal  0.505489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3179  adenylosuccinate synthetase  54.08 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2742  adenylosuccinate synthetase  54.78 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2683  adenylosuccinate synthetase  54.33 
 
 		 429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0285  adenylosuccinate synthetase  51.76 
 
 		 429 aa  464  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0510  adenylosuccinate synthetase  53.63 
 
 		 429 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.37093  normal  0.446838 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1281  adenylosuccinate synthetase  52.29 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0564  adenylosuccinate synthetase  47.2 
 
 		 431 aa  437  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0676  adenylosuccinate synthetase  51.61 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.678663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0461  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0337  adenylosuccinate synthetase  47.65 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1825  adenylosuccinate synthetase  54.13 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.260214  normal  0.42401 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6278  adenylosuccinate synthetase  54.13 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.544992  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1801  adenylosuccinate synthetase  54.13 
 
 		 448 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1523  adenylosuccinate synthetase  48.39 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000140547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3251  adenylosuccinate synthetase  48.36 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1712  adenylosuccinate synthetase  53.67 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.12828  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5102  adenylosuccinate synthetase  53.67 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1739  adenylosuccinate synthetase  53.67 
 
 		 448 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1070  adenylosuccinate synthetase  51.61 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.763716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1226  adenylosuccinate synthetase  52.06 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000419397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3379  adenylosuccinate synthetase  50.93 
 
 		 436 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2974  adenylosuccinate synthetase  50.23 
 
 		 435 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2076  adenylosuccinate synthetase  53.33 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1473  adenylosuccinate synthetase  53.44 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209737  normal  0.290596 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1583  adenylosuccinate synthetase  50.57 
 
 		 440 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.147694  unclonable  0.000000227018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2096  adenylosuccinate synthetase  52.28 
 
 		 447 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1978  adenylosuccinate synthetase  49.88 
 
 		 432 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1409  adenylosuccinate synthetase  52.29 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000087591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0176  adenylosuccinate synthetase  48.59 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1606  adenylosuccinate synthetase  52.06 
 
 		 448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54976  normal  0.323715 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2530  adenylosuccinate synthetase  51.83 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00750177  hitchhiker  0.00000299679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07600  Adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0073  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1333  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018876  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2216  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.130698  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1095  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1162  adenylosuccinate synthetase  51.15 
 
 		 446 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.502883 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2344  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2178  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2245  adenylosuccinate synthetase  52.98 
 
 		 448 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1823  adenylosuccinate synthetase  53.21 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2958  adenylosuccinate synthetase  45.26 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2641  adenylosuccinate synthetase  45.26 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2180  adenylosuccinate synthetase  48.6 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000134883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1985  adenylosuccinate synthetase  49.43 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.151418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0607  adenylosuccinate synthetase  48.83 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.272974 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0203  adenylosuccinate synthetase  47.91 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.773480000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0183  adenylosuccinate synthetase  47.17 
 
 		 451 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2007  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1939  adenylosuccinate synthetase  48.95 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0518  adenylosuccinate synthetase  47.09 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.289891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2029  adenylosuccinate synthetase  46.96 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00381049  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2857  adenylosuccinate synthetase  50.11 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0662  adenylosuccinate synthetase  47.21 
 
 		 431 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.681047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0441  adenylosuccinate synthetase  49.31 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.83493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4765  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 430 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4941  adenylosuccinate synthetase  49.41 
 
 		 430 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>