More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5701 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  100 
 
 		 223 aa  453  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  100 
 
 		 219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  82.11 
 
 		 219 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  77.93 
 
 		 217 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  79.34 
 
 		 219 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  79.34 
 
 		 219 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  79.34 
 
 		 219 aa  357  7e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  79.34 
 
 		 219 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  78.3 
 
 		 219 aa  350  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  77.83 
 
 		 219 aa  349  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  75.94 
 
 		 219 aa  348  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  75.94 
 
 		 219 aa  348  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  75.94 
 
 		 219 aa  348  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  75.94 
 
 		 219 aa  348  4e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  75.94 
 
 		 219 aa  348  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  75.94 
 
 		 219 aa  348  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  77.83 
 
 		 219 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  77.83 
 
 		 219 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  77.83 
 
 		 219 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  77.83 
 
 		 219 aa  348  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  75.47 
 
 		 219 aa  345  3e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  75.47 
 
 		 219 aa  345  4e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  76.89 
 
 		 234 aa  343  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  72.86 
 
 		 219 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  73.33 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  71.83 
 
 		 219 aa  333  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  70.09 
 
 		 220 aa  331  6e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  68.64 
 
 		 220 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  67.77 
 
 		 211 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  71.71 
 
 		 239 aa  324  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  68.35 
 
 		 219 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  70.19 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  70.19 
 
 		 211 aa  315  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  67.77 
 
 		 216 aa  308  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  66.83 
 
 		 211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  63.81 
 
 		 211 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  62.38 
 
 		 211 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  57.48 
 
 		 239 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  57.01 
 
 		 239 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  56.54 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  56.54 
 
 		 239 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  53.74 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  53.27 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  52.34 
 
 		 246 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  53.49 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  53.52 
 
 		 242 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  53.02 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  52.34 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  54.55 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  51.47 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  48.51 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  50.97 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  49.27 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  47.87 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  50 
 
 		 225 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  49.27 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  49.5 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  46.35 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  50 
 
 		 231 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  50.5 
 
 		 234 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  42.36 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  44.34 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  46.46 
 
 		 227 aa  195  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  45.54 
 
 		 278 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  43.07 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  43.07 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  44.55 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  45.55 
 
 		 272 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  44.33 
 
 		 284 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  41.09 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  175  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  47.34 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  38.42 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  39.42 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  36.76 
 
 		 211 aa  147  8e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  36.76 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  36.76 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  36.67 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  37.93 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  36.32 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  37.8 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.86 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  34.48 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  43.02 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.11 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  36.59 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  34.12 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  37.38 
 
 		 749 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  37.75 
 
 		 754 aa  138  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  39.82 
 
 		 877 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  35.07 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  36.27 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  36.59 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  32.85 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  35.07 
 
 		 244 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  36.92 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 787 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>